Human Cot-1 DNA

 

Human Cot-1 DNA

二代测序技术的快速发展使得测序成本大幅降低，然而就现阶段而言，全基因组重测序的成本依然很高，且得到的海量数据分析速度缓慢，无法大规模地应用。靶向测序技术可以将感兴趣的基因组区域富集出来进行测序，通过对几十个、或者几百个基因的深度测序，找出突变。单个样本测序数据产出少且分析速度较快，因此更能经济高效地发挥NGS技术的优势，广泛应用到临床检测、健康筛查等众多领域。另外，靶向测序可以对目标区域进行深度测序，增加了目标区域内遗传变异的检测灵敏度和准确性，在低频突变位点的检出方面有很大优势。

 

在靶向捕获流程中，需要结合不同变异类型，对靶区DNA序列设计序列探针，同时在探针的末端加上生物素标记。在液相杂交体系中，根据DNA碱基互补配对原理，使用生物素标记的探针将靶区序列捕获出来，然后利用链霉亲和素磁珠将探针及结合到探针上的靶区序列捕获下来，通过PCR扩增进一步富集，即得到NGS捕获后的文库。

 

由于文库构建过程中引入了大量的非靶区DNA序列，如重复序列、接头和标签序列等。这些序列又具有高度的相似性，会在杂交捕获过程中，干扰探针和靶区的结合，引入大量非特异性捕获，导致捕获效率降低。所以在靶向捕获过程中，需要将非靶区DNA序列进行封闭，阻断文库之间的串联反应发生，提高数据利用率。

  

在液相杂交捕获中，针对重复序列常用的封闭试剂为Human Cot-1 DNA或Salmon Sperm DNA，其中Human Cot-1 DNA主要用于人源样本中重复序列的封闭，Salmon Sperm DNA主要用于非人源样本中重复序列的封闭。

 

Human Cot-1 DNA来源于人胎盘中提取的基因组DNA，为人基因组中长约50至300 bp的高度重复序列，能够方便、有效地对探针或待检测样品的核酸序列中的重复序列进行封闭，屏蔽重复序列，从而避免核酸杂交过程中非特异性杂交信号的干扰，以便增强核酸杂交的效果，最终实现对待检测核酸样本中的核酸序列的有效捕获，起到“封闭（block）”的作用。

  

舒桐Human Cot-1 DNA产品

产品信息

 

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Human Cot-1 DNA	500μg/支	欢迎垂询	点击购买

 

 

产品应用
 

• Northern杂交

• Southern杂交

• 原位杂交（组织原位杂交、体细胞原位杂交、荧光原位杂交）

• 液相杂交捕获

• 可用作文库筛选探针来筛选体细胞杂合体文库和由体细胞杂合体组成的流式分选染色体文库

 

产品优势
 

• 质控严格：使用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测产品大小和纯度，保证平均片段大小在50~300 bp；A260/A280在1.8~2.0

• 高纯度：无 HIV1,2 RNA, HCV RNA, HBV DNA污染

• 提供工业级大包装：可按要求进行不同规格定制

 

 

参考文献

【1】Bao P, Frutos A. G, Greef C, et al. Anal Chem (2002) 74:1792-1799

【2】Tang Y M, Wo Y Y, Stewart J, et al. J Biol Chem  (1996) 271:28324-28354

【3】Trifonov V.A, Vorobieva N.N, Rens W. Springer (2009): FISH With and Without COT1 DNA.

 

品牌：Generulor

货号：f002