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热变性没做好,WB 也可能没条带!

2023-02-17 18:11

  • WB 上样前一定要加热变性吗?

  • 用变性裂解液提取的蛋白已经变性了,还需要加 Loading buffer 再加热变性吗?

  • 膜蛋白和普通蛋白热变性条件一样吗?

  • 膜蛋白样品煮沸之后,WB 检测 Na+/K+ATPase 内参为什么没有条带?

  • 蛋白样品煮过后于 -80 ℃ 储存,再次使用前还需要再煮吗?

在 WB 样品制样过程中你是否一直有以上这些疑问?今天咱们就来一探究竟!

 

WB 上样前一定要加热变性吗?

凝胶电泳之前蛋白质需要进行变性预处理,以确保蛋白质变成一级结构线性表位,便于与一抗抗体结合。通常情况下,蛋白样品加入上样缓冲液(Loading buffer),沸水浴 5 min 或者是 PCR 仪 95 ℃ 处理 5 min 即可,这个过程即是热变性。

热变性过程利用 Loading buffer 里的还原剂二硫苏糖醇(DTT)或者巯基乙醇,打断蛋白间的二硫键使之成为线性。同时蛋白肽链上的氨基酸与 Loading buffer 中的 SDS 结合,使整个肽链携带上负电荷,使蛋白之间只有大小区别,跑电泳时即可通过小蛋白在前、大蛋白在后区分开。

▶   答案:WB 样品上样前一定要加热变性。

 

 

蛋白已经变性了还用加 Loading buffer 再变性吗?

WB 蛋白样品制备通常会使用变性裂解液,因此提取得到的蛋白已经变性,但在 WB 凝胶电泳前仍需要加上样品缓冲液进行热变性。变性裂解液在裂解细胞提取蛋白时,变性裂解液因含有离子型表面活性剂使得蛋白的高级结构(二级结构,三级结构)被破坏,但仍可能有部分蛋白没有完全成为一级结构。

所以在 WB 上样之前需要加 Loading buffer 进行热变性使蛋白更加彻底的变性。而且 Loading buffer 中含有的溴酚蓝可以起到指示作用,显示电泳进程,成分中的甘油还可以加大样品密度,使样品沉到样品孔里,防止样品飘出。

▶ 答案:虽然提取蛋白的过程已经使蛋白变性,仍然需要加 Loading buffer 进行热变性。

 

膜蛋白应该怎么热变性?

分离提取的亚细胞结构,例如细胞质膜、线粒体、高尔基体、内质网、溶酶体以及内体等这些亚细胞结构用变性溶解液溶解后,依然需要加 Loading buffer 进行热变性。但是膜蛋白在高温煮沸时,容易发生聚集现象,形成二聚体或多聚体,聚集后分子量变大,造成后续无法检测到条带或检出的条带位置不对。这也是膜蛋白样品煮沸后,WB 检测 Na+/K+ATPase 质膜内参蛋白,没有条带的原因。多家抗体公司在说明书里指出,膜蛋白样品不宜煮沸,建议 70 ℃ 左右进行热变性。

还有一些对热特别敏感的蛋白,对热变性的温度有特殊要求。植物样品中对热敏感的蛋白比较多,有的蛋白热变性温度需要与感受态转化温度(42 ℃)一样,过高则检测不到。

例如,某老师在进行植物质膜蛋白 WB 检测时,70 ℃ 热变性,内参可以检测到,但目标蛋白却检测不到,为此将样品做了梯度温度热变性后检测(见下图),经过实验发现目标蛋白在 30 ℃ 热变性时检测效果最佳,随着热变性温度增高,条带减弱,至 70 ℃ 时完全无法检测出。

▶ 答案:如果样品是膜蛋白,需要根据样品本身情况,谨慎调整热变性的温度,以提高检测效率。

 

冷冻过的样品再使用还要再次加热吗?

样品加 Loading buffer 煮过后分装放在 -80 ℃ 冻存,如果是短期存放一两周,可以不用再次加热,因为 Loading buffer 里的还原剂还没有消耗光,蛋白还处于稳定变性中。还原剂消耗完后,线性结构蛋白被打开的二硫键就又会构建成新的二硫键,蛋白因此可能会出现沉淀。

▶ 答案:短期不用,但长时间的保存后再使用时需要按照原来热变性温度进行变性,同时还需要补加还原剂。

 

 

小结

综上可知,WB 电泳前制样的热变性不是简单煮沸;提取的蛋白已经变性依然需要进一步热变性;分离得到的膜蛋白进行 WB 试验千万不要煮沸,70 ℃ 左右即可;热敏感的蛋白,检不到的时候,可以摸索调整一下热变性的温度;煮样之后冻存的样品,需要根据情况添加还原剂以及热变性后才可以使用。

 

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