罗氏 NimbleGen 比较基因组杂交(CGH )芯片在近期研究中
帮助鉴别精神疾病相关的新型基因组疾病的特征
高分辨率的比较基因组杂交技术(CGH)已迅速成为分子细胞遗传学检测所选择的一种方法,并被用来鉴别与精神发育迟滞、癌症和其它复杂表型相关的染色体异常的特征。在《医学遗传学杂志》最近公布的两项研究中,高分辨率的NimbleGen CGH芯片被用来进一步鉴别近期识别出的两种基因组疾病的特征。
在第一项研究中,van Bon和同僚们采用定制的NimbleGen CGH 12x135K 和 4x72K 芯片,准确地描绘出了一系列伴有发育迟缓和正常核型的人体内的15q13区域的染色体断裂位点。对15q13.3 微缺失综合症的初步鉴定显示,在类似于Prader Willi综合症、Angelman综合症和Williams-Beuren综合症(3)的弱智患者中经常出现这一症状。在目前对其他18人进行的隐匿性15q13.3 缺失研究分析显示,其中至少有11人出现差异较大的家族内和家族间疾病特征,且伴有遗传性缺失。除此之外,在来自四个家族的10位兄弟姐妹中,有7人也带有隐匿性缺失,其疾病特征表现为轻度发育迟缓、幼儿学习障碍和无可识别表型的不同症状。在对同一区域出现重复综合症的4人的分析中,无法找到共同的可识别表型,尽管发现其中2人的精神不正常。有趣的是,在近期对16名精神分裂症患者进行的一项研究中发现15q13区域的染色体缺失,其中1人还患有孤独症。 以上所有这些研究的数据都将 15q13.3微缺失综合症与各种疾病特征联系在一起,包括正常发育至轻度和重度的精神发育迟滞和精神疾病,并对“遗传自明显正常的父母的染色体异常通常没有临床意义”的惯常说法发起了挑战。
与染色体17q21.31有关的第二种新型基因组疾病最近被识别出来,截止目前,在医学文献中公布的17q21.31缺失共有14例。在初步报告中,定制的NimbleGen CGH芯片被用来界定一个最小的临界 478 kb缺失区域。在当前的研究中,Koolen和同僚们采用一个定制的 NimbleGen 385K 芯片,准确地描绘出了其他5位受感染患者中的染色体断裂位点。该分析的结果把17q21.31临界区域缩小至一个含有至少6个基因的424 kb区域,其中包括与多种神经变性疾病有关的MAPT 基因。此外,NimbleGen CGH芯片在双亲样本中识别出了与致病性缺失有关的特异性多态。
以上所有这些研究的数据都把17q21.31微缺失综合症确认为在临床上和分子上均可识别的基因组疾病,在患有无法解释的精神发育迟滞、且大部分尚未诊断出的人群中的发病频率为0.64%。
上述这些研究说明了,NimbleGen CGH芯片凭借独具特色的高分辨率与高灵活性的设计,使新型微缺失综合症的识别和分子特性研究成为可能的,它还使人们认识到了此类综合症能代表无法预知且差异很大的疾病特征。持续对微缺失和重复综合症的识别与特征描述进行研究对建立起临床诊断标准是至关重要的。
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