线上论坛｜GeoMx DSP 空间多组学技术在肿瘤免疫研究和治疗领域的应用浅谈

NanoString 与非因生物诚意邀请您参加于 2020 年 3 月 20 日举行的「GeoMx DSP 空间多组学技术在肿瘤免疫研究和治疗领域的应用浅谈」的线上研讨会。

GeoMx DSP 是 NanoString 最新发布的用于空间生物学研究的技术平台，可以用于组织切片空间原位高通量蛋白和基因的表达检测。本次会议由 NanoString, 非因生物以及冷泉港生物技术联合举办，主要内容涵盖了非因生物的空间生物学技术服务平台，GeoMx DSP 的技术原理和空间生物学在肿瘤免疫等热门领域应用，最后会分享刚刚在美国佛罗里达结束的 Advances In Genome Biology And Technology (AGBT) 会议的空间基因组学峰会的精选内容。

在疫情肆虐的 2020 年，在抗疫前行的同时，我们不能忘记肿瘤及其他疾病依然对人类健康造成重大威胁。本次新冠疫情也暴露出我们对于各类疾病，比如感染在致病机理以及组织器官损伤机理的理解比较有限，如何建立快速有效的组织空间生物标志物发现以及药物筛选平台，并和临床病理学相结合将会是未来多个医学领域的研究热点和方向。

本次会议旨在通过探讨空间多组学技术在生物标志物及分子机理的研究和最新进展，并希望能够在肿瘤免疫学，神经生物学乃至传染病学等多个领域带动新的研究方向。

会议详情

日期：2020 年 3 月 20 日

时间：北京时间上午 9 点-12 点

语言：中文

平台：Zoom (登录详情请见确认邮件链接)

演讲嘉宾

王楠博士

首席技术官

非因生物

非因生物 GeoMx Digital Spatial Profiler 空间组学技术介绍

嘉宾简介

王楠博士毕业于英国纽卡斯尔大学（Newcastle University, UK）医学分子生物学专业， 欧盟玛丽居里博士全奖获得者。王楠博士曾担任英国北方蛋白组学分析中心（NEPAF）研究员，英国纽卡斯尔大学蛋白组分析中心（NUPPA）研究员并作为英国 ArrayGen 公司技术主管带领新型蛋白组学应用开发，拥有多项国家发明专利。目前，王楠博士任职非因生物首席技术官。

聂海生博士

中国区市场拓展经理

NanoString Technologies

GeoMx Digital Spatial Profiler 技术和应用简介

嘉宾简介

聂海生博士现任职 NanoString 公司中国区市场拓展经理, 负责 NanoString 技术和产品在肿瘤学, 免疫学和神经科学等转化医学市场的商业推广。 加入 NanoString 之前，聂海生博士曾在二代测序技术公司 Illumina 工作过九年，负责技术和销售市场推广工作, 专注于新的基因组学技术在中国市场的技术和商业推广。在本次讲座中，聂海生博士主要会介绍 NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler 技术平台的原理，工作流程，靶向基因方案，和该技术在基因组学应用中的特点和优势.

梁燕博士

病理学总监

NanoString Technologies

Technology Access Program for the GeoMx Digital Spatial Profiler

嘉宾简介

梁燕博士毕业于日本信州大学组织病理学. 现任职 NanoString 公司总部病理部门总监. 带领负责 NanoString 技术在肿瘤学, 免疫学和神经科学等转化医学市场的应用发展 (Technology Access Program). 加入 NanoString 之前，梁燕博士曾建立管理自己的病理学服务公司. 梁燕博士主要介绍 Technology access program in NanoString GeoMx DigitalSpatial Profiler 技术平台的应用，工作流程和优势.

马上登记：http://emarketing.nanostring.com/LP=249

联合举办

关于 GeoMx Digital Spatial Profiler

新一代空间组学解密工具

在胚胎学，神经学以及肿瘤免疫学中，组织的空间信息以及各类细胞的组成对于研究疾病以及组织发育过程有着重要意义。肿瘤微环境的复杂性和样本异质性更是当前肿瘤免疫研究及转化医学面临的重大挑战。目前绝大部份的关于分子诊断或者生物标志物的临床应用，往往是基于单一组织活检。然而如下图所示，癌组织与癌旁组织在同一组织活检中无法分离，导致可能具有重要诊断指示的生物标志物难以被发现。因此在未来，无论是转化医学抑或是临床医学，都需要对组织的空间信息进行进一步的细分和探索。

因此研究人员常常应用免疫组织化学（Immunohistochemistry, IHC）和 H＆E 染色以更好明白组织的空间结构以及不同细胞在这些空间结构中的功能。但是 IHC 每次可以包含的靶物数目有限，依靠传统技术研究人员一次只能测定 3-4 个靶物，并且样本无法重复使用，难以实现高通量的关于 RNA 或者蛋白的定量测试。

这种鱼与熊掌不能兼得的情况随着空间多靶标技术的到来即将得到革命性的改变。Nanostring 生物技术的 GeoMx Digital Spatial Profiler 是新一代空间多靶标分析系统，是目前市面上唯一具有高通量，多组学和弹性选择感兴趣区域的平台，完美结合了荧光造影，免疫组织化学和基因转录组学技术，为研究人员描绘出最全面最清晰的生物学图像，解决了传统分析平台无法同时获取形态学信息和多重靶标表达数据的难题。

技术原理

GeoMx Digital Spatial Profiler 采用独家专利技术在抗体或者 RNA 上偶联 DNA Oligo。每个 DNAOligo 对应一个靶标，最高可达 96 个蛋白靶标或>1000 个 RNA 靶标（二代测序输出）。当抗体或 RNA 与组织上的靶标结合后，GeoMx DigitalSpatial Profiler 利用激光切断 DNA oligo 与抗体或 RNA 之间的连接物，从而释放出 DNA Oligo 以进行下一步定量。

产品特点

多靶标

Nanostring 生物技术的 GeoMx Digital Spatial Profiler 一天之内可以处理多达 20 个组织切片样本。每个样本可以包含多达 96 个蛋白和>1000 个 RNA 靶物。

多组学

如何在同一组织样本中实现多组学研究向来是临床医学的棘手问题。目前市面上现有平台受制于技术，只能进行 RNA 或者蛋白测定。而 GeoMx Digital Spatial Profiler 则正好填补了这一空白。它不仅可以一次性测定多达 96 个蛋白，而且还可以同时进行多过 1000 个 RNA 靶物的测定，完美实现多组学研究。

高精度

激光激活的精度范围最小为 10 微米，可达到单细胞水平。因此研究人员可以对极其稀有的细胞群体进行捕获。

样本无损

整个操作过程于样本无接触无损伤。同一样本可以重复使用并用于其他实验。

弹性选择感兴趣区域（ROI）

由于不同组织的独有特点，研究人员往往在单一载玻片上可能对某一区域特别感兴趣。在保留组织样本完整性的情况下，GeoMx DigitalSpatial Profiler 可以允许使用者在单张载玻片上根据组织轮廓选取感兴趣区域（Region Of Interest, ROI），甚至选取稀有细胞群体进行分析。

使用简单

GeoMx Digital Spatial Profiler 操作简单。数据分析不需要额外的生物信息分析支持，有利于生物标志物的快速发现。研究人员可以根据实验需要采取自动挑选或者手动挑选结合的方式。

操作流程

1. 多靶标抗体染色

2. 根据荧光抗体染色图像挑选感兴趣区域（Region of Interest, ROI）

3. 对每个 ROI 进行 UV 照射，切割下 Oligo

4. 毛细管吸取仅限于 ROI 的 Oligo, 全程与样本无直接接触

5. 吸取的 Oligo 转移至 96 孔板中。

6. 步骤 3-5 会重复直至所有 ROI 的 Oligo 都收集完毕

7. 所有 ROI 中的 Oligo 分别收取完后，将在 NanoString 生物技术的 nCounter 上进行定量

*荧光抗体及靶标抗体在同一步骤染色，无需重复加样和染色

*步骤 4-6 为全自动操作，无需研究人员操作。

数据分析

在 Oligo 定量结束后，研究人员可以在 GeoMx Digital Spatial Profiler 的数据分析系统上整合形态学图像以及数字化定量的数据，把 ROI 在组织上的空间位置以及区域内所有靶标的表达水平相互关联起来，以达到在单一操作界面上同时观察空间定位，细胞形态和靶标表达的相关性。

数据展示

云操作系统及远程质量监控

GeoMx Digital Spatial Profiler 在操作上采用云技术实现实验数据的处理，储存，分析，共享，有利多用户多中心大型临床医学研究的开发。

部分现有菜单

GeoMx Digital Spatial Profiler 已开发出基于该平台的生物标志物的商业用试剂盒，可用于肿瘤免疫及神经退行性疾病的生物标志物的研究及开发。研究人员可以根据自身需要对待测靶标进行组合。以下为目前已有的部分蛋白试剂盒以供借鉴。如需了解更多关于其他蛋白以及 RNA 靶标，请联系我们的中国销售团队 (jlin@nanostring.com/13201409947)

肿瘤免疫学蛋白菜单

肿瘤免疫学 RNA 菜单

神经生物学蛋白菜单

肿瘤转录组部分信号通路（1833 靶物）

牛文利器

NanoString 生物技术的 GeoMx Digital Spatial Profiler 从去年预售发行到今年为止，已经有三篇应用该技术的文章发表在 Nature Medicine 上了。由耶鲁大学病理学部门主任 David Rimms 领头的关于 GeoMx Digital Spatial Profiler 在黑色素瘤中的应用更是被作为 10 月的 Clinical Cancer Reserach 封面刊。

参考文献

1.Amaria R.N. et. al., Neoadjuvant immunecheckpoint blockade in high-risk resectable melanoma Nature Medicine (2018)

2.Blank C.U. et. al.,Neoadjuvant versus adjuvant ipilimumab plus nivolumab in macroscopic stage IIImelanoma. Nature Medicine (2018)

3.Jonson et al. 「A case report of clonal EBV-like memory CD4+ T cell activation in fatalcheckpoint inhibitor-induced encephalitis.」 Nature Medicine (2019)

4. Rimm D, et al.High-plex predictive marker discovery for melanoma immunotherapy treated patients using Digital Spatial Profiling. Clinical Cancer Research (2019)

5.Ihle C, et al.Distinct tumor microenvironment of lytic and blastic bone metastases in prostate cancer patients. Journal for Immuno Therapy of Cancer (2019)

6. Rozeman EA, Prevoo W, et al. Phase Ib/II trial testing combined radiofrequency ablation and ipilimumab in uveal melanoma (SECIRA-UM). Melanoma Res. (2019)

7. Farren MR, Sayegh L, et al. Immunologic alterations in the pancreatic cancer microenvironment of patients treated with neoadjuvant chemo- and radiotherapy. JCI Insight (2019)

8.Helmink B, Wargo J, et al.B-cells and tertiary lymphoid structures (TLS) contribute to immune checkpoint blockade response. Nature (2020)

9.Cabrita R, Jönsson G, et al. Tertiary lymphoid structures improve melanoma survival and immunotherapy response. Nature 2020

更多详情

关于本次会议及更多产品优惠信息，请联络 NanoString 生物技术中国分公司

林森

电邮：jlin@nanostring.com｜手机号：132 2014 9947｜微信：knightoFtruth

图片来源：纳斯瑞