随着 1 月 8 日起我国对新型冠状病毒实施「乙类乙管」，国内的新冠疫情防控进入了新阶段，抗疫工作的重心也从「防感染」转到「保健康、防重症」。对于各级政府来讲，稳妥有序实施「乙类乙管」是一项复杂的系统工程，面临着新形势和新任务。

在这一背景下，国家疾控部门进一步完善新冠病毒变异监测的工作方案，确保人民群众的健康安全，在本土案例监测方面，每个省份都选择了部分的城市和医院作为监测哨点，对门诊病历、重症和死亡病例开展一定数量的新冠病毒感染病例的采样和序列测定。

广州医科大学附属市八医院（以下简称广州市八医院）作为「入境患者定点收治医院」， 一直动态监测新冠病毒变异的趋势，以便能够及时动态掌握人群感染发病水平和变化趋势，科学研判和预测疫情规模、强度和流行时间，动态分析病毒株变异情况。

近日，广州市八医院基于华大智造的 MGISEQ-2000 基因测序仪、ATOPlex RNA 多重 PCR 建库试剂盒套装 V3.1 以及 MetargetCOVID 软件的测序组合，在收治的境外输入新冠病毒感染者中检测出了 BQ.1.25、XBB.1、XBB.2 等奥密克戎亚型变异毒株。

图 1：测序报告显示测出 BQ.1.25、XBB.1 及XBB.2 等变异毒株

据悉，华大智造 MGISEQ-2000 是一款灵活高效的测序平台，搭配 2 种通量的载片：大载片（FCL）和小载片（FCS），可独立上机，单次运行数据产量可从 55Gb 到 1,440Gb；ATOPlex RNA 多重 PCR 建库试剂盒套装 V3.1 则采用 328 对混合引物（平均扩增 178bp）来捕获新冠病毒全基因组序列信息，对于低浓度、易降解的样本友好、具有极高的灵敏度。再配合支持批量样本快速分析 MGI MetargetCOVID 软件，可实现对新冠病毒的准确分型。

图 2：广州市八医院工作人员在华大智造 MGISEQ-2000 上操作新冠样本测序

通过华大智造 MGISEQ-2000、ATOPlexV3.1 及 MetargetCOVID 软件的测序组合，广州市八医院能够单次完成 96* 个新冠样本的测序工作，得到病毒序列全长覆盖率达到 99% 以上，测序效率高，测序结果质量优异。

图 3：广州市八医院工作人员使用 MGI MetargetCOVID 软件进行样本毒株分型

事实上，早在 2021 年 5 月，华大智造就为广州市八医院提供新冠病毒测序工作提供工具支撑。仅在 2021 年 5 月 21 日至 2021 年 6 月 18 日不到 1 个月的时间里，该院就确诊出 159 例新冠 Delta 毒株病例。依托华大智造的 ATOPlex 技术平台和 MGISEQ-2000 测序仪的测序组合产品，广州市八医院联合广州医科大学附属第一医院等单位成功实现对新冠 Delta 病毒全基因组的测序、比对、分型和溯源。

「华大智造提供的国产高通量测序工具组合准确、高效、操作简便，为新冠病毒变异监测提供了强大的技术支撑。」广州医科大学附属市八医院传染病研究所主任李锋对于华大智造的测序工具组合表示了肯定。

作为国产测序仪龙头，华大智造致力于成为「生命科技核心工具缔造者」，其掌握的高通量测序技术在病原的监测和溯源以及公共卫生事件的应对中发挥着极其重要的作用。后续针对医疗机构、公共卫生机构开展新型冠状病毒感染疫情监测的需求，华大智造实时、全景、全生命周期的测序产品组合，将持续助力病毒变异监测工作，为新阶段下的防控工作贡献一份力量。

（图文来源：华大智造）