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发表于《基因组医学》5月刊基因沉默、血清代谢组学分析、癌症基因调控网络推断等

2019-08-27 14:40

《基因组医学》五月号上发表的三篇研究文章强调了后基因组技术在解决癌症发生和改进治疗设计方面的潜力。

首先,Peter Scacheri和他的同事对结肠癌细胞中基因的表观遗传沉默是如何实现的提供了一种见解。该研究首次表明,与CpG富岛启动子相同,非CpG富岛启动子的沉默依赖于胞嘧啶的高甲基化和H3K4me3标记物的丢失。

Oliver bath和他的同事进行的另一项研究具有重要的临床意义,因为它分析了结肠直肠癌不同阶段患者的血清代谢组学特征能否预测其转移状态。研究人员发现确实如此,这为准确评估疾病的阶段提供了一种新的方法。因此,本研究的发现可能有助于提供更个性化的治疗方法。

第三项研究是对9种最先进的基因调控网络推断方法的综合比较分析,报告了不同方法在准确性上的巨大差异。将最有效的方法应用于卵巢癌数据集,Mark Ragan和合作者能够预测已报道的和新的调控相互作用,这可能是潜在的药物靶点。这项研究发表在《澳大利亚人》杂志上,是癌症生物信息学专题系列的一部分。

同时,提出了一种新的计算预测框架Consensus,用于不确定基因变异的评估,有助于改进数据可视化和临床决策。

委托的文章包括审查Nadav Ahituv和同事讨论下一代测序将更好的理解监管元素变化的角色在不同的治疗药物的反应,而回顾Philippos Patsalis和Elisavet Papageorgiou覆盖非整倍性的非侵入性产前诊断的最新进展。《自然-遗传学》杂志最近发表了三篇关于紫外线敏感综合征的研究报告,《自然-遗传学》杂志还刊登了丹尼尔·麦克阿瑟关于2012年基因组疾病会议的会议报告。

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