研选★FFPE 样本 | 空间转录组测序

提供商 ：伯豪生物

服务名称 ：伯豪生物FFPE 样本空间转录组测序科研服务

规格 ：以电话报价为准

技术介绍   伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案

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空间转录组技术不仅可以提供研究对象的转录组等数据信息，同时还能定位其在组织中的空间位置，对癌症发病机制、神经科学、发育生物学等众多领域的研究来说都具有重要意义。目前该技术主要适用于新鲜冷冻组织样本，临床通常使用的 FFPE（福尔马林固定石蜡包埋）样本资源无法得到更加高效的应用。目前针对 FFPE 样本的空间基因表达解决方案，可以从 FFPE 样本中以高灵敏度和高特异性分析相关基因的空间表达信息。


技术优势   伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案

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1、打破对新鲜冰冻样本的局限性，使临床上大量的 FFPE 样本得到充分利用；
2、RNA 模板连接（RTL) 探针集，具有高敏感性和特异性，且探针集覆盖了人和小鼠超过 18000 个基因；
3、可以结合更广泛的病理信息和预后信息，筛选生物标记物、进行回顾性和纵向研究，揭示更广泛更深入的生物学问题。

Visium FFPE 实验流程    伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案

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样本要求   伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案

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1、满足组织贴片实验（不脱片）；
2、RNA 完整性：DV200>50%。


数据分析    伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案

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通过生物信息分析直观地展示 spot 分群和 spot 亚群在组织切片上的空间分布以及差异基因的空间分布。此外，还提供高级分析、个性化分析等丰富的分析内容，包括单细胞数据与空转数据的联合分析等。  
参考文献    伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案

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文章名称：Tertiary lymphoid structures generate and propagate anti-tumor antibody-producing plasma cells in renal cell cancer
发表时间：2022 年 3 月
发表期刊：Immunity
影响因子：31.428
发表单位：法国索邦大学 Cordeliers 研究院


伯豪生物客户项目发文     伯豪生物提供 FFPE 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务解决方案

文章名称	杂志	IF	发表年份
Single-cell and spatial analysis reveal interaction of  FAP+ fibroblasts and SPP1+ macrophages in  colorectal cancer	Nature Communications	17.694	2022
Clinical challenges of tissue preparation for spatial transcriptome	Clinical and Translational Medicine	8.554	2022

 

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