NadPrep®️ 血浆游离 DNA 双端分子标签文库构建试剂盒（for MGI）
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文献和实验
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库存 ：1
英文名 ：NadPrep cfDNA Library Preparation Kit (for MGI)
供应商 ：纳昂达（南京）
保存条件 ：-20℃
NadPrep®️ 血浆游离 DNA 双端分子标签文库构建试剂盒（for MGI）是针对基于 DNBSEQ™ 技术的 MGI 高通量测序平台开发的双链 DNA 文库构建试剂盒。该试剂盒基于 A-T 连接原理，操作流程简单，适用于 1-500 ng 血浆游离DNA的全基因组测序 ，同时兼容液相杂交靶向捕获测序。该试剂盒搭配双端分子标签（Bi-Molecular Identifier, BMI）接头，可满足血浆游离 DNA 低频突变分析的需求。
产品特色
- 适用于血浆游离 DNA
- 样本起始量低，文库转化率高
- 双端分子标签接头助力低频突变分析
- 包含 DNA 纯化磁珠，并适配优化的片段筛选方案
- 单端接头（Single Index, SI）和双端唯一接头（MGI Unique Dual Index, MDI）可选
建库应用
| 应用方向 |
样本类型 |
推荐起始量 |
| 全基因组测序 |
血浆游离 DNA（无大片段污染） |
≥ 1 ng（依据检测需求调整） |
| 靶向捕获测序 |
血浆游离 DNA（无大片段污染） |
≥ 1 ng（依据检测需求调整） |
建库流程
产品表现
文库产出稳定高效
图1. NadPrep®️ 血浆游离 DNA 双端分子标签文库构建试剂盒（for MGI）对不同 DNA 起始量的文库产出。A. 搭配 NadPrep®️ BMI Adapter (MDI) Module 时 cfDNA 文库的产出稳定；B. 搭配 MDI 接头模块时的 cfDNA 文库片段分布示例（Agilent 2100 Bioanalyzer）。
分子标签助力低频突变分析
图2. 双端分子标签分析原理示意图。
来源于两个健康捐献者的 cfDNA 以 1% 比例混合，文库制备总投入量为 10 ng，人工模拟 1% 及 0.5% 突变。在 MGISEQ-2000 测序平台上，利用双端分子标签，在不同分析与过滤方法下进行低频突变分析的结果示例如下。
表1. 低频突变分析过滤方法
| 分析与过滤方法 |
详情 |
| No BMI |
根据片段在基因组上比对的起始、终止位点去除重复。 |
| SSCS |
利用单链分子标签进行一致性分析（Call Molecular Consensus Reads），形成单链一致性序列（Single Strand Consensus Sequence, SSCS）。 |
| DCS211 / DCS633 |
利用双链分子标签，即互补链（Top / Bottom）分子标签进行一致性分析，形成双链一致性序列（Duplex Consensus Sequence, DCS），且 Top 与 Bottom Reads 均 ≥1（DCS211）/ 3（DCS633）。 |
| DCS211 (≥ 2) / DCS633 (≥ 2) |
在DCS211 / DCS633 的基础上，支持该突变的DCS一致性序列 ≥ 2。 |
图3. 不同分析模式对于 1% 和 0.5% 模拟突变位点的 A. 灵敏度与 B. 阳性预测值。
图4. 不同分析模式对背景 “噪音” 的过滤情况。
产品订购信息
| 类别 |
产品 |
详情 |
货号 |
| 建库模块 |
24 rxn |
1002211 |
|
| NadPrep®️ DNA Library Preparation Module (for MGI), 96 rxn |
96 rxn |
1002212 |
|
| 单端接头模块 |
NadPrep®️ BMI Adapter (SI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn |
SI 1-12 |
1003811 |
| NadPrep®️ BMI Adapter (SI) Module Set D1 (for MGI), 480 rxn |
SI 1-96 |
1003820 |
|
| NadPrep®️ BMI Adapter (SI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn |
SI 1-24 |
1003821 |
|
| NadPrep®️ BMI Adapter (SI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn |
SI 25-48 |
1003822 |
|
| 双端唯一接头模块 |
NadPrep®️ BMI Adapter (MDI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn |
MDI 1-12 |
1003911 |
| NadPrep®️ BMI Adapter (MDI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn |
MDI 1-24 |
1003921 |
|
| NadPrep®️ BMI Adapter (MDI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn |
MDI 25-48 |
1003922 |
|
| NadPrep®️ BMI Adapter (MDI) Module Set B3 (for MGI), 96 rxn |
MDI 49-72 |
1003925 |
|
| NadPrep®️ BMI Adapter (MDI) Module Set B4 (for MGI), 96 rxn |
MDI 73-96 |
1003926 |
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入驻年限：4年
