极端混池分析（BSA）-欧易生物

提供商 ：上海欧易生物医学科技有限公司

服务名称 ：极端混池分析（BSA）

极端混池分析（BSA）
 

服务优势

周期短、定位准、性价比高
与传统的图位克隆相比，耗时短、成本低、定位更准确

丰富的建库经验，优秀的建库质量
多年文库构建技术沉淀，具有复杂样品处理能力和丰富的建库经验；

临床数据质量与数量相结合，已成功完成拟南芥、水稻、玉米等多个物种突变体定位项目
CLIA 认证实验室，5S 实验规范管理，多套计算集群，保证数据产出质量和分析速度，助力诸多客户发表上千篇高水平文章；

专业个性化的生物信息分析
专业成熟的生物信息分析团队，据物种基因组大小、复杂度和研究目的，选择不同的分析策略，灵活进行定制化信息分析；

结果展示

图 | 连锁定位图

 

 常见问题 

 

1.没有亲本是否可以做MBS？

可以做，但是有风险。可以获得连锁区域，但是不能获得候选基因。

2.没有基因组信息的物种可以做MBS吗？

不可以。MBS项目要求染色体级别的基因组，且有详细的注释信息。

3.如何判断是质量性状还是数量性状？

质量性状的表型服从二项分布，或者说只有两种表型的性状，可以将两种表型定义为有、无。如叶色：绿色、紫色，绿色为野生型，紫色为突变型，可以理解为绿色为无、紫色为有。数量性状的表型呈现出连续分布的状态，如身高、体重、籽粒的长宽等。

4.质量性状是否可以只测突变型子代混池？

可以，但是会降低定位精确度。

5.提取子代DNA时应当先混后提，还是先提后混？

二者都可以。考虑测序效果的话，是将个体先抽提再混合；考虑成本的话，则是将等量的组织先混合再抽提。

6.子代群体规模不够，应该优先取极端还是优先取数量？

建议优先取极端。表型准确比数量更重要，背景表型干扰对数据本身影响较大。如果极端表型个体太少，建议扩大群体 。

7.定位效果不理想的原因是什么？

影响因素很多，主要有以下几点：

1）亲本之间遗传背景差异比较大，除目标性状外，还有很多其他差异，对定位分析有较大干扰，难以定位；

2）性状统计复杂，目标性状可能是由多个简单性状构成，可以考虑拆分性状，重新定位；数量性状本身定位难度也比

较高，具有一定不可控性；

3）测序数据有污染，可以通过抽取部分测序数据在nr库里做blast，检查比对结果；

4）分析方法不同，可以分别用其他分析方法（如ED法和snp-index法）进行定位，比较定位结果。

8.定位区间如何进一步缩小？

使用亲本设计Indel/SNP标记或增加测序深度。