16S rDNA菌种/擎科生物

提供商 ：TSINGKE

服务名称 ：16S rDNA菌种

16S rDNA菌种
16S rDNA是编码原核生物核糖体小亚基Rrna(16S rRNA)的DNA序列，存在于所有细菌染色体基因组中。16S rDNA分子大小适中，突变率小，是细菌系统分类学研究中最常用，最有用的“分子钟”。其序列包含9个可变区（variable region）和10个恒定区（constant region）。保守序列区域反映了生物物种间的亲缘关系，而高变序列区域则能体现物种间的差异。16S rDNA的序列特征为不同分类级别的近缘种系统分类奠定了分子生物学基础。
采用测序方法对各种细菌的16S rDNA进行了广泛的研究，获得了大量的16S rDNA序列信息，并汇集到NCBI数据库中。将测序得到的16S rDNA序列在NCBI上进行Blas比对，即可获知与该序列同源性较高的已知序列，为确定菌种的分类学地位提供依据。

实验流程

送样要求

1.基因组DNA样品，请确保浓度≥ 10ng/ul，总体积≥10ul，A260/A280比值为1.8左右。
2.除基因组DNA样品外，仅接收培养过的菌液, 体积≥ 1ml，请确保您提供的样品经过平板或斜面上的单菌落分离。因实验样品不纯造成的测序套峰，我们将收取全额的实验费用。
3.若提供的菌株为革兰氏阳性菌，建议您提供基因组DNA。
4.我们不接受具有致病性的样品。如果您的菌株带有致病性，请提供菌株的基因组DNA，并对其进行处理以灭活致病菌。

我们可以提供的服务

1.提取细菌基因组DNA。
2.扩增16S rDNA序列，约1500bp左右。
3.PCR纯化后安排测序。
4.根据测序结果得到的序列上NCBI比对。

服务价格

项目内容	样品类型	价格
细菌16S rDNA菌种鉴定	基因组DNA	200元/样本
	菌液	300元/样本

提供结果

1.测序峰图文件及序列文件。
2.分析及比对情况。

服务说明

1．送测菌液样品应在平板或斜面至少分离三次以上的单菌落培养。
2．若无法培养分析的细菌，可以采用连入T载体后挑取多个单菌落测序。