产品详情
文献和实验
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保存条件 :-25~-15℃避光保存,避免反复冻融。
英文名 :2×T5 Fast qPCR Mix(Probe)
库存 :充足
供应商 :北京擎科生物科技股份有限公司
规格 :5×1.0 mL
2×T5 Fast qPCR Mix(Probe)
快速耐脏型探针法专用qPCR试剂
【产品特点】
抗体修饰的热启动酶,灵敏度高、特异性强、稳定性好;
特别优化的反应缓冲液,重复性好,可信度高;
配有适合不同机型的ROX Reference Dye。
【产品简介】
本产品是采用探针法进行Real Time PCR的专用试剂,可对目的片段进行快速、高特异性的定量检测。产品中包含经抗体修饰的热启动DNA聚合酶及特别优化的反应缓冲液系统,显著提高了扩增的特异性和灵敏度,可在较宽的定量区域内得到良好的标准曲线,对靶基因进行准确地定量与检测。配套的ROX Reference Dye I/II可用于校正仪器孔间误差。本产品为浓度2×的预混液,使用时只需添加模板、引物、探针和ddH2O,使Mix工作浓度为1×即可。
【产品组成及保存】
-25~-15℃避光保存,避免反复冻融。
组分 | 规格 |
2×T5 Fast qPCR Mix(Probe) | 5×1 mL |
50×ROX Reference Dye I(High) | 200 µL |
50×ROX Reference Dye II(Low) | 200 µL |
【操作流程】
1.在PCR管中配制如下反应液,混匀短暂离心后,上机反应。
20 µL | |
2×T5 Fast qPCR Mix(Probe) | 10 µL |
10 µM Primer F | 0.8 µL |
10 µM Primer R | 0.8 µL |
10 µM Probe* | * |
50×ROX Reference Dye I/II** | 0.4 µL |
Template DNA/cDNA | *** |
ddH2O | Up to 20 µL |
*反应中探针引物终浓度0.2 μM 即可得到较好的扩增效果,也可以根据实际情况在0.2~1 μM之间进行调整。
**根据不同仪器类型选择ROX
**如果模板为DNA,建议用量不超过100 ng,如果模板为cDNA,建议用量不超过总反应体系的1/10,根据稀释梯度结果确定用量。
2.推荐如下qPCR反应程序 (两步法)
**根据不同仪器类型选择ROX
**如果模板为DNA,建议用量不超过100 ng,如果模板为cDNA,建议用量不超过总反应体系的1/10,根据稀释梯度结果确定用量。
2.推荐如下qPCR反应程序 (两步法)
温度 | 时间 | 循环次数 | 采集荧光 | ||
1 | 预变性 | 95 ℃ | 2~5 min* | 1 cycle | / |
2 | 循环反应 | 95 ℃ | 10 s | 40 cycles | / |
60 ℃ | 20-50 s** | 采集 |
*如果模板为cDNA,反应2 min,模板为DNA反应5 min。
**使用两种或以上的探针,反应时间可以增加至50 s。
【问题讨论】
Q1:使用探针法进行荧光定量,该如何选择探针?
A1:选择报告荧光基团时首先要确认激发波长和发射波长与仪器匹配。对于多重荧光反应,标记不同探针的报告基团染料的最大发射波长应该至少有15 nm的差异。
对于淬灭荧光基团,必须保证其吸收光谱与报告基团的发射光谱有重合。
尽量不要选择TAMRA作为淬灭基团。因为TAMRA本身就是个荧光基团,虽然它也有淬灭作用,但也会加强本底荧光强度。
**使用两种或以上的探针,反应时间可以增加至50 s。
【问题讨论】
Q1:使用探针法进行荧光定量,该如何选择探针?
A1:选择报告荧光基团时首先要确认激发波长和发射波长与仪器匹配。对于多重荧光反应,标记不同探针的报告基团染料的最大发射波长应该至少有15 nm的差异。
对于淬灭荧光基团,必须保证其吸收光谱与报告基团的发射光谱有重合。
尽量不要选择TAMRA作为淬灭基团。因为TAMRA本身就是个荧光基团,虽然它也有淬灭作用,但也会加强本底荧光强度。
淬灭基团种类以及使用的报告基团种类的选择 | |||||||||
淬灭基团种类 | 淬灭基团性质 | 使用的报告基团种类 | |||||||
TAMRA | 荧光物质 | AM、HEX、TET、JOE 等 | |||||||
BHQ 系列染料 |
BHQ1 | 非荧光物质 | AM、HEX、TET、JOE 等 | ||||||
BHQ2 | 非荧光物质 | Cy3、TAMRA、ROX、Texas Red、Cy5 等 | |||||||
BHQ3 | 非荧光物质 | Cy5 等 | |||||||
荧光基团与淬灭基团的适配建议 | |||||||||
荧光基团 |
最大激发波长 |
最大发射波长 |
可选择的淬灭基团 | ||||||
BHQ1 | BHQ2 | BHQ3 | DABCYL | TAMRA | |||||
480-580(535) | 550-650(579) | 620-730(672) | 380-550(453) | 470-560(544) | |||||
FAM | 494 nm | 荧光物质 | ✓ | ✓ | |||||
TET | 521 nm | 非荧光物质 | ✓ | ✓ | ✓ | ||||
JOE | 520 nm | 非荧光物质 | ✓ | ✓ | ✓ | ||||
HEX | 535 nm | 非荧光物质 | ✓ | ✓ | ✓ | ||||
VIC | 538 nm | ✓ | ✓ | ✓ | |||||
CY3 | 552 nm | ✓ | ✓ | ✓ | |||||
TAMRA | 560 nm | ✓ | |||||||
ROX | 587 nm | ✓ | |||||||
CY5 | 649 nm | ✓ | ✓ |
Q2:如何设计一条好的探针?
A2:
长度和位置:探针长度通常在20-30 bp,确保达到好的猝灭效果。探针5’应尽可能靠近上游引物3',但不要重叠,以确保Taq DNA聚合酶快速切割降解。
序列:避免连续的单碱基重复序列,尤其是G,这可能会影响探针的二级结构,并降低杂交效率。特别是探针的5'端的第一个碱基不能为G,它能淬灭荧光。比如即使单个G碱基与FAM荧光报告基团相连时,G也可以淬灭FAM基团所发出的荧光信号,从而导致假阴性的出现。探针内部或探针与两条引物之间避免3个碱基以上的互补序列。
熔解温度:Taqman探针的Tm要比引物Tm高约10℃,通常在65~70℃,以确保探针与模板结合的稳定程度大于引物与模板结合的稳定程度,这样可保证探针在退火时先于引物与目的片段结合。新型Taqman MGB探针通过在探针上共轭一个MGB基团可以使探针Tm提高10℃,使得探针长度只需要13~20 bp,其特异性和灵敏性都更高,常用于SNP分型。
保守性:探针序列要求绝对保守,有时分型就单独依靠探针来决定。理论上有一个碱基不配对,就可能检测不出来。若找不到完全保守的片段,也只能选取有一个碱基不同的片段。且这个不同的碱基最好在探针的中间,对探针与目的片段的杂交影响不大,不同的碱基最好不要在两端,不利于探针的杂交。且最好为A或T,而不能为G或C。
BLAST检索确认探针特异性。为确保引物探针的特异性,最好将设计好的序列在BLAST中核实一次,若发现有非特异性互补区,建议重新设计引物探针。
Q3:探针法qPCR出现直线型扩增曲线是什么原因?
A3:探针部分降解会导致直线型扩增。一般稀释的探针可在4°C保存至少3个月,探针的反复冻融会导致降解;探针在光线下暴露时间太长也会引起降解。反应液中有PCR抑制物也会导致直线型扩增。
【实例分享】
完美精准分型
以不同人类基因组gDNA样本为模板,对rs4947963位点进行分型
本试剂产品仅供科学研究或进一步生产使用,不可用于临床诊断或治疗。
北京擎科生物科技股份有限公司
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