2×T5 Fast qPCR Mix(Probe)/快速耐脏型探针法专用试剂/荧光定量系列/擎科生物TSINGKE

2×T5 Fast qPCR Mix(Probe)/快速耐脏型探针法专用试剂/荧光定量系列/擎科生物TSINGKE

价格: ¥1200

品牌:擎科生物 品牌认证

货号:TSE301

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产品详情

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保存条件 :-25~-15℃避光保存,避免反复冻融。

英文名 :2×T5 Fast qPCR Mix(Probe)

库存 :充足

供应商 :北京擎科生物科技股份有限公司

规格 :5×1.0 mL

2×T5 Fast qPCR Mix(Probe
快速耐脏型探针法专用qPCR试剂


【产品特点】
抗体修饰的热启动酶,灵敏度高、特异性强、稳定性好;
特别优化的反应缓冲液,重复性好,可信度高;
配有适合不同机型的ROX Reference Dye。

【产品简介】
本产品是采用探针法进行Real Time PCR的专用试剂,可对目的片段进行快速、高特异性的定量检测。产品中包含经抗体修饰的热启动DNA聚合酶及特别优化的反应缓冲液系统,显著提高了扩增的特异性和灵敏度,可在较宽的定量区域内得到良好的标准曲线,对靶基因进行准确地定量与检测。配套的ROX Reference Dye I/II可用于校正仪器孔间误差。本产品为浓度的预混液,使用时只需添加模板、引物、探针和ddH2O,使Mix工作浓度为即可。

【产品组成及保存】
-25~-15℃避光保存,避免反复冻融。
组分 规格
2×T5 Fast qPCR Mix(Probe) 5×1 mL
50×ROX Reference Dye I(High) 200 µL
50×ROX Reference Dye II(Low) 200 µL

操作流程
1.在PCR管中配制如下反应液,混匀短暂离心后,上机反应。
  20 µL
2×T5 Fast qPCR Mix(Probe 10 µL
10 µM Primer F 0.8 µL
10 µM Primer R 0.8 µL
10 µM Probe* *
50×ROX Reference Dye I/II** 0.4 µL
Template DNA/cDNA ***
ddH2O Up to 20 µL
*反应中探针引物终浓度0.2 μM 即可得到较好的扩增效果,也可根据实际情况0.2~1 μM之间进行调整。
**根据不同仪器类型选择ROX
**如果模板为DNA,建议用量不超过100 ng,如果模板为cDNA,建议用量不超过总反应体系的1/10,根据稀释梯度结果确定用量。

2.推荐如下qPCR反应程序 (两步法)
    温度 时间 循环次数 采集荧光
1 预变性 95 ℃ 2~5 min* 1 cycle /
2 循环反应 95 ℃ 10 s 40 cycles /
60 ℃ 20-50 s** 采集
*如果模板为cDNA,反应2 min,模板为DNA反应5 min
**使用两种或以上的探针,反应时间可以增加至50 s

【问题讨论】
Q1:使用探针法进行荧光定量,该如何选择探针?
A1:选择报告荧光基团时首先要确认激发波长和发射波长与仪器匹配。对于多重荧光反应,标记不同探针的报告基团染料的最大发射波长应该至少有15 nm的差异。
对于淬灭荧光基团,必须保证其吸收光谱与报告基团的发射光谱有重合。
尽量不要选择TAMRA作为淬灭基团。因为TAMRA本身就是个荧光基团,虽然它也有淬灭作用,但也会加强本底荧光强度。
淬灭基团种类以及使用的报告基团种类的选择
淬灭基团种类 淬灭基团性质 使用的报告基团种类
TAMRA 荧光物质 AM、HEXTETJOE

BHQ 系列染料
BHQ1 非荧光物质 AM、HEXTETJOE
BHQ2 非荧光物质 Cy3、TAMRAROXTexas RedCy5
BHQ3 非荧光物质 Cy5 等
荧光基团与淬灭基团的适配建议

荧光基团

最大激发波长

最大发射波长
可选择的淬灭基团
BHQ1 BHQ2 BHQ3 DABCYL TAMRA
480-580(535) 550-650(579) 620-730(672) 380-550(453) 470-560(544)
FAM 494 nm 荧光物质      
TET 521 nm 非荧光物质    
JOE 520 nm 非荧光物质    
HEX 535 nm 非荧光物质    
VIC 538 nm      
CY3 552 nm      
TAMRA 560 nm          
ROX 587 nm          
CY5 649 nm        

Q2如何设计一条好的探针?
A2
长度和位置探针长度通常在20-30 bp,确保达到好的猝灭效果探针5’应尽可能靠近上游引物3',但不要重叠,以确保Taq DNA聚合酶快速切割降解
序列:避免连续的单碱基重复序列,尤其是G,这可能会影响探针的二级结构,并降低杂交效率。特别是探针的5'端的第一个碱基不能为G,它能淬灭荧光。比如即使单个G碱基与FAM荧光报告基团相连时,G也可以淬灭FAM基团所发出的荧光信号,从而导致假阴性的出现探针内部或探针与两条引物之间避免3个碱基以上的互补序列
熔解温度:Taqman探针的Tm要比引物Tm高约10,通常在65~70以确保探针与模板结合的稳定程度大于引物与模板结合的稳定程度,这样可保证探针在退火时先于引物与目的片段结合。新型Taqman MGB探针通过在探针上共轭一个MGB基团可以使探针Tm提高10使得探针长度只需要13~20 bp,其特异性和灵敏性都更高,常用于SNP分型。
保守探针序列要求绝对保守,有时分型就单独依靠探针来决定。理论上有一个碱基不配对,就可能检测不出来。若找不到完全保守的片段,也只能选取有一个碱基不同的片段。且这个不同的碱基最好在探针的中间,对探针与目的片段的杂交影响不大,不同的碱基最好不要在两端,不利于探针的杂交。且最好为A或T,而不能为GC。
BLAST检索确认探针特异性。为确保引物探针的特异性,最好将设计好的序列在BLAST中核实一次,若发现有非特异性互补区,建议重新设计引物探针。

Q3:探针法qPCR出现直线型扩增曲线是什么原因?
A3:探针部分降解会导致直线型扩增。一般稀释的探针可在4°C保存至少3个月,探针的反复冻融会导致降解;探针在光线下暴露时间太长也会引起降解。反应液中有PCR抑制物也会导致直线型扩增

【实例分享】
完美精准分型
以不同人类基因组gDNA样本为模板,对rs4947963位点进行分型

 

本试剂产品仅供科学研究或进一步生产使用,不可用于临床诊断或治疗。

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