研选全转录组测序
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产品简介
全转录组是特定组织或细胞在特定状态下转录产生所有RNA总和，包含编码RNA和非编码RNA，目前非编码RNA研究主要集中在具有调控功能的small RNA（以miRNA为代表），长链非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）和环状RNA（circular RNA, circRNA）。全转录组测序可同时对同一样本中的mRNA、miRNA、lncRNA及circRNA进行测序分析，快速全面准确地获得与特定生物学过程相关的RNA及ceRNA调控机制，有助于深入挖掘生命现象背后的转录调控问题。
产品优势
1份总RNA，2种文库，4种RNA分析，省时省量；
全面ceRNA关联分析，深入探究转录调控机制；
两者、三者及四者联合分析，发表多篇文章，性价比高；
标准分析+个性化分析+多组学联合分析，专业全面；
同一批样本，可比性更强。
技术路线
结果展示
差异表达RNA分析
全基因组范围内的差异分析可以发现多组样品之间的差异mRNA、circRNA、miRNA及lncRNA。根据每种RNA类型的数据，对差异分组之间进行差异RNA筛选，然后通过饼图展示同一差异组合不同类型RNA所筛选出的差异RNA数目。
关键基因KEGG通路整合分析
根据RNA之间复杂调控网络，基于随机游走方式选择网络中的关键RNA中的基因进行通路富集分析，选择最显著富集的前5个通路。提取这5个通路中基因与基因之间的关系整合成通路网络，并将关键基因比对到通路网络，更直观展示RNA之间的调控关系。
差异基因相关靶向RNA分析
差异mRNA，差异lncRNA的所有靶基因，差异miRNA的所有靶基因，差异circRNA的所有来源基因的交集以Venn图的形式展示，有助于快速筛选调控mRNA的非编码RNA。
差异lncRNA-miRNA-mRNA调控网络
基于ceRNA网络，对每个差异组合提取三者都差异的关系对，采用Cytoscape绘制网络图，筛选与表型性状相关的调控网络。
常见问题
1、Q：全转录组测序物种适用范围是什么？
A：适用有完善参考基因组的真核生物。
2、Q：全转录组一般推荐数据量？
A：普通二倍体物种一般推荐16G+10M，多倍体物种可以测16G+20M。
3、Q：全转录组建库方式有几种？
A：有两种建库方案： 第一种方案：构建2个文库，1）去核糖体链特异性文库：分析lncRNA、circRNA及mRNA；2）小RNA文库：分析miRNA。 第二种建库方案，构建3个文库，1）去核糖体链特异性文库：分析lncRNA和mRNA；2）去核糖体去线性链特异性文库：分析circRNA；3）小RNA文库：分析miRNA。
全转录组是特定组织或细胞在特定状态下转录产生所有RNA总和，包含编码RNA和非编码RNA，目前非编码RNA研究主要集中在具有调控功能的small RNA（以miRNA为代表），长链非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）和环状RNA（circular RNA, circRNA）。全转录组测序可同时对同一样本中的mRNA、miRNA、lncRNA及circRNA进行测序分析，快速全面准确地获得与特定生物学过程相关的RNA及ceRNA调控机制，有助于深入挖掘生命现象背后的转录调控问题。
产品优势
1份总RNA，2种文库，4种RNA分析，省时省量；
全面ceRNA关联分析，深入探究转录调控机制；
两者、三者及四者联合分析，发表多篇文章，性价比高；
标准分析+个性化分析+多组学联合分析，专业全面；
同一批样本，可比性更强。
技术路线
结果展示
差异表达RNA分析
全基因组范围内的差异分析可以发现多组样品之间的差异mRNA、circRNA、miRNA及lncRNA。根据每种RNA类型的数据，对差异分组之间进行差异RNA筛选，然后通过饼图展示同一差异组合不同类型RNA所筛选出的差异RNA数目。
关键基因KEGG通路整合分析
根据RNA之间复杂调控网络，基于随机游走方式选择网络中的关键RNA中的基因进行通路富集分析，选择最显著富集的前5个通路。提取这5个通路中基因与基因之间的关系整合成通路网络，并将关键基因比对到通路网络，更直观展示RNA之间的调控关系。
差异基因相关靶向RNA分析
差异mRNA，差异lncRNA的所有靶基因，差异miRNA的所有靶基因，差异circRNA的所有来源基因的交集以Venn图的形式展示，有助于快速筛选调控mRNA的非编码RNA。
差异lncRNA-miRNA-mRNA调控网络
基于ceRNA网络，对每个差异组合提取三者都差异的关系对，采用Cytoscape绘制网络图，筛选与表型性状相关的调控网络。
常见问题
1、Q：全转录组测序物种适用范围是什么？
A：适用有完善参考基因组的真核生物。
2、Q：全转录组一般推荐数据量？
A：普通二倍体物种一般推荐16G+10M，多倍体物种可以测16G+20M。
3、Q：全转录组建库方式有几种？
A：有两种建库方案： 第一种方案：构建2个文库，1）去核糖体链特异性文库：分析lncRNA、circRNA及mRNA；2）小RNA文库：分析miRNA。 第二种建库方案，构建3个文库，1）去核糖体链特异性文库：分析lncRNA和mRNA；2）去核糖体去线性链特异性文库：分析circRNA；3）小RNA文库：分析miRNA。
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