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文献和实验
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提供商 :研载生物科技
服务名称 :差异分析
差异分析
1.分析目的获取两个不同分组间的mRNA/lncRNA/miRNA表达、DNA位点甲基化的差异
2.数据来源
基因表达谱、非编码基因表达谱、DNA甲基化(客户自己测序,或者来源于GEO/TCGA等公共数据库的RNAseq、MicroArray、Methylation450K数据等)
3.分析方法
将样本分组为实验组和对照组,使用主流分析工具Limma[1]进行差异分析,所有基因经过统计检验后得到相应的P.Value值,使用Benjamini & Hochberg方法[2]进行多重检验校正。我们从log2差异倍数(logFC)和显著性(P.Value或adj.P.value)两个指标来衡量基因的差异表达水平,设定阈值(如adj.P.Value<=0.05且|logFC|>=1)对差异基因进行筛选
4.交付文件
(1)基因差异表达结果,包括各个基因的logFC、p value等信息(Excel)
(2)差异基因火山图;top差异基因表达值的聚类热图
5.分析结果示例图
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