差异分析

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提供商 :研载生物科技

服务名称 :差异分析

差异分析

1.分析目的
获取两个不同分组间的mRNA/lncRNA/miRNA表达、DNA位点甲基化的差异
2.数据来源
基因表达谱、非编码基因表达谱、DNA甲基化(客户自己测序,或者来源于GEO/TCGA等公共数据库的RNAseqMicroArrayMethylation450K数据等)
3.分析方法
将样本分组为实验组和对照组,使用主流分析工具Limma[1]进行差异分析,所有基因经过统计检验后得到相应的P.Value值,使用Benjamini & Hochberg方法[2]进行多重检验校正。我们从log2差异倍数(logFC)和显著性(P.Valueadj.P.value)两个指标来衡量基因的差异表达水平,设定阈值(如adj.P.Value<=0.05|logFC|>=1)对差异基因进行筛选
4.交付文件
1基因差异表达结果,包括各个基因的logFCp value等信息(Excel
2)差异基因火山图;top差异基因表达值的聚类热图
5.分析结果示例图



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