16s/宏基因测序服务

内容简介

        16S/18S rDNA分别是编码原核/真核细胞核糖体小亚基的DNA序列，而真菌18S、5.8S和28S rDNA基因间隔序列称为ITS，ITS分为两个区域：ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之间，ITS2位于5.8S和28S之间。细菌的16S rDNA，真核微生物的ITS或18S rDNA序列，既有结构与功能上的高度保守性，又有种属间高变性的特征，非常适合研究环境微生物群落结构组成、挖掘样品间微生物差异、研究其物种多样性。
        环境微生物多样性检测是指通过对环境中微生物的16S rDNA 、18S rDNA或ITS高变区的PCR扩增产物进行高通量测序并分析该环境下微生物群落的多样性及特征，因此微生物扩增子测序又被称为微生物多样性测序。常用于疾病与人体肠道、表皮微生物的关系研究，肠道、瘤胃（如产甲烷菌类群）与动物健康/营养消化的研究等领域。          传统16S/18S 扩增子测序仅针对16S/18S rDNA的单个或连续的两到三个可变区进行分析，无法精确的“种”的分类鉴定。借助于三代测序平台PacBio的超长读长，可以弥补二代测序技术的短板，可轻松读取微生物16S/18S rDNA全长序列，提高了菌株在种水平的分辨能力，真正精确到“种”的分类鉴定。此外，还能提高样本中微生物组成鉴定的精确度，从而更加真实的还原样本中微生物的群落结构。            宏基因组学（Metagenomics），利用新一代高通量测序技术（NGS）以特定环境下微生物群体基因组为研究对象，在分析微生物多样性、种群结构、进化关系的基础上，可进一步探究微生物群体功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系，发掘潜在的菌群基因功能意义。与传统微生物研究方法相比，宏基因组测序技术规避了绝大部分微生物不能培养、痕量菌无法检测的缺点，因此近年来在微生物学各个领域研究中得到了广泛应用。

服务项目

项目名称	靶向区域	技术特点
微生物区域扩增子序列	16S的V3+V4 18S的V4/V9 ITS的ITS1/ITS2	价格低廉；不低于5万reads/样品，保证检测到样品中的痕量微生物；Hiseq（PE250）测序，大幅提高测序读长和检测的准确性。
微生物全长扩增子序列	16S/18S rDNA全长序列	采用三代测序技术，2kb文库构建，全长16S测序，可以进行菌种鉴定。
宏基因组测序	PE150/5-6G data	应用于微生物群体基因组成多样性和丰度，微生物的群落结构、物种分类、进化关系、微生物与宿主间的互作关系和发掘新的或具备特定功能的基因。

 

技术优势