文献支持绝对定量转录组测序（Digital mRNA-seq）

价格根据样本可能有差异，产品详情请咨询张经理：13871149015

绝对定量产品系列： mRNA-seq、miRNA、lncRNA、circRNA

简介

绝对定量转录组测序在文库扩增之前为每一条逆转录的cDNA片段加上唯一的身份标签（Unique Identifier，UMI或UID），也称为数字标签。数字标签会伴随片段扩增、测序、分析的全过程。同一个片段经过PCR扩增出来的产物均带有相同的数字标签，测序完成后利用UMI追溯每一个片段的来源，将相同来源的片段（具有相同的序列和UMI）进行合并，就能准确去除PCR扩增重复，一比一准确还原样本扩增前的原始状态。在此过程中，PCR扩增和测序错误同样可以被纠正：扩增和测序的错误会使得相同UMI标签对应多个不同的序列，那么只需比较这些序列的相似性，即可纠正这些错误。


绝对定量转录组利用UMI技术排除PCR扩增偏好和错误影响，可对表达量作准确的定量分析，与qPCR检测结果高度一致。绝对定量转录组测序为您带来全新的体验。
 

康测技术优势

• 建库起始量从1ug降低到100ng，更适合稀少珍贵的样本。
• 准确筛选差异表达基因，既不错选也不漏掉。
• 避免低丰度转录本丢失，构建可靠的共表达网络。
• 准确检测寄生菌或内生菌的转录表达情况。对于难以分离的寄生菌，测序数据中有大量的宿主基因的转录本，通常需加大测序深度才能检测到寄生菌的转录本，而加大测序深度无疑又增加错误的几率、导致准确度下降。UID技术可去重并纠错，排除加大测序深度造成的影响，并对寄生菌的转录组准确定量。
• 在分析cSNP位点时，由于UID技术具有纠错功能，可排除假阳性位点，准确锁定真实的cSNP位点。
• UID技术的纠错功能同样帮助确定可变剪接位点、RNA编辑，有助于可变剪接、RNA编辑的准确分析。

                    建库方法                                               技术流程

       KC-DigitalRNA测序结果通过qPCR验证                     建库起始量仅需100ng


       提高clean data中unique reads的比例                     良好的样本重复性
    

 

低丰度转录本的检测

某菌（植物的寄生菌，无法与植物组织分离）的转录组测序，将植物、某菌的参考基因组进行混合，然后比对，继而提取仅比对到该菌参考基因组上的reads，占比2.53%，大部分read（比对到植物参考基因组）未比对到该菌参考基因组。



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