MeRIP测序 | 核酸-蛋白互作研究

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核酸-蛋白互作研究系列产品:ChIP测序RIP测序CLIP测序MeRIP测序

简介

m6A甲基化修饰在基因表达调控、mRNA剪接、RNA编辑、RNA稳定性、控制mRNA寿命和降解、介导环状RNA翻译等方面扮演重要角色。

甲基化RNA免疫共沉淀结合高通量测序(Methylated RNA Immunoprecipitation with Next Generation Sequencing,MeRIP-Seq)是研究细胞内转录组表观修饰的最新技术。这项技术通过使用N6-甲基腺嘌呤抗体富集高甲基化的RNA片段,然后结合高通量测序,在全转录组范围内研究发生甲基化的RNA区域,从而比较不同细胞、组织、样本间的RNA甲基化修饰模式的差异,可帮助解决细胞分化、生物发育、疾病发生发展、热休克反应等生物学问题。

康测技术优势

  1. 对抗体进行严格质检、效价分析,提供文章发表质量的IP报告;
  2. 对MeRIP实验体系进行精心优化
  3. 特有的Peak calling技术
  4. 提供个性化分析报告,可根据客户需要提供关联分析、解析m6A调控机制

建库方法                                                       技术流程

  

分析结果展示


A)reads在基因上的覆盖情况:在peak区域,IP的reads覆盖度高于input(没有使用抗体富集的对照),(横轴为基因位置,左边纵轴为覆盖度);           
B)Peak在基因5'UTR、CDS、3'UTR区域的分布;
C)基于差异m6A基因和差异表达的mRNA的联合分析(绿色三角表示显著差异的m6A修饰基因,黄色圆圈表示显著差异表达的基因,橙色五角星表示同时显著差异m6A修饰和显著差异表达的基因);
D)Peak的motif分析。

 

武汉康测科技有限公司是由加州大学圣地亚哥分校(UCSD)、武汉大学、华中农业大学博士团队创建的高新技术企业。截至2017年底,团队核心成员已在Nature、Cell、Molecular Cell、Nat. Struct. Mol. Biol.、Proc Natl Acad Sci USA、Cell Reports等国际顶级期刊发表文章十余篇。公司秉承技术创新、服务至上的核心理念,与多所985/211院校、中国科学院的实验室建立了长期合作关系。

公司研发团队于2017年成功开发出绝对定量转录组(KC-DigitalRNA)、免疫组库(KC-IRQuant)、16S rDNA绝对定量、ctDNA检测(KC-SMP)等4项建库技术,并成功申请发明专利和配套数据分析系统的软件著作权。成为中国首家UID(UMI)绝对定量高通量测序服务平台,为广大科研工作者提供转录组(mRNA、lncRNA)/TCR/BCR/ctDNA/肠道微生物多样性等多种绝对定量测序服务。

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