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文献和实验
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服务名称 :CUT&Tag
CUT&Tag是蛋白质-DNA互作关系研究的新方法,是通过针对靶蛋白(如转录因子、染色质重塑蛋白)的抗体和Protein A的介导,使得与Protein A融合的Tn5酶(Tagmentase)在切割DNA片段的同时在序列两端加上测序接头,经PCR扩增后形成可以直接用于高通量测序的文库。随后对文库进行测序分析,探究目的蛋白结合的DNA片段。
ChiTag是Protein A蛋白与Tn5转座酶的融合蛋白,当抗体结合目的蛋白(如转录因子、组蛋白等)后,Protein A蛋白可直接结合抗体,携带的Tn5转座酶可特异性的切割目的蛋白附近的DNA片段,并将DNA片段连上接头,文库构建之后可进行高通量测序。相对其他技术,CUT&Tag技术需要的样本量较少,并且其实验信噪比较高,背景较少。
样本要求:
细胞:>5×104个,
动物组织:≥0.2 g
植物组织:≥0.5 g
真核微生物:协商
建库测序:
测序策略:Illumina Hiseq, PE150
测序深度:6-12 G
测序策略:Illumina Hiseq, PE150
测序深度:6-12 G
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