CHIRP

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提供商 :晶莱生物

服务名称 :免疫共沉淀(CHIRP)实验服务

规格 :实验服务

RNA绑定的DNA和蛋白相互作用:CHIRP
 

免疫共沉淀实验(Chromatin Isolation by RNA Purification,CHIRP)是一种检测体内与RNA绑定的DNA和蛋白相互作用的方法,可同时分析lncRNA/circRNA 、蛋白及DNA三者互作关系。

 
CHIRP实验意义
lncRNA可与蛋白质、DNA和RNA相互作用,实现多样化功能,CHIRP可以探讨lncRNA与其互作的DNA、蛋白质的功能与作用机制,是相关科学研究工作的有力工具。lncRNA的研究在表观遗传调控等生命活动中发挥重要作用,CHIRP是研究lncRNA的重要技术手段,可在全基因组范围内鉴定RNA与染色质的互作,并对其进行定性、定量及定位的分析。
 
CHIRP实验原理
CHIRP(Chromatin Isolation by RNA Purification)是通过结合生物素的核酸探针,将目标RNA拉下来,与之共同作用的DNA染色体片段(DNA与蛋白质复合体)就会被吸附下来,最后可以通过qRT-PCR、WB、测序分析和质谱分析等检测RNA、DNA和蛋白质。

CHIRP的实验流程
①探针设计:设计反义寡核苷酸探针;
②细胞培养;
③破碎细胞;
④生物素标记的DNA探针与RNA杂交;
⑤CHIRP;
⑥RNA、DNA及核酸结合蛋白提取;
⑦分析检测。
 
结果展示
 



 
实验完成周期及交付标准
1. 实验周期:1-3个月
2. 交付标准:CHIRP鉴定结果报告、分析报告、实验报告(试剂、耗材、实验步骤)、原始数据等
 
实验需与客户确认的信息
1. 目的基因与蛋白信息。
2. 样本类型与种属
3. 是否需要生信分析
 
参考文献
[1] Iyer S , Modali S D , Agarwal S K . The Long Non-Coding RNA MEG3 is an Epigenetic Determinant of Oncogenic Signaling in Functional Pancreatic Neuroendocrine Tumor Cells[J]. Molecular and Cellular Biology, 2017:MCB.00278-17.
[2] Chu C , Chang H Y . Understanding RNA-Chromatin Interactions Using Chromatin Isolation by RNA Purification (ChIRP).[J]. Methods in Molecular Biology, 2016, 1480.
[3] Zhu J J , Fu H J , Wu Y G , et al. Function of lncRNAs and approaches to lncRNA-protein interactions[J]. Science China Life Sciences, 2013, 56(10):876-885.
 

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