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ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing) 是2013年由斯坦福大学William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室开发的用于研究染色质可及性(通常也理解为染色质的开放性)的方法, 原理是通过转座酶Tn5容易结合在开放染色质的特性,然后对Tn5酶捕获到的DNA序列进行测序。这些开放的区域代表基因组上的转录活跃区域。
单细胞ATAC-seq基于转座酶介导的测序引物插入开放的染色质区域。像普通的ATAC-Seq一样,该测定法提供了染色质开放和可及区域的轮廓。这些轮廓指示了单细胞分辨率下的活跃调控区域。
我们的scATAC-Seq服务可以同时检测数千个细胞的全基因组染色质可及性,从而可以检测异种群体中的细胞亚群,这种细胞亚群的信息会在普通ATAC-Seq中丢失。
ATAC-Seq能解决什么问题 ?
ATAC-Seq技术服务包括:
1, 样本准备(组织或细胞)
2, Tn5酶切处理
3, 文库构建
4, 测序
5, 数据分析
Active Motif ATAC-Seq 发表文章(近年文章列表可下载文末附件):
Gulfem Dilek Guler.et al.Repression of Stress-Induced LINE-1 Expression Protects Cancer Cell Subpopulations from Lethal Drug Exposure,Cancer Cell,2017.07.002
Active Motif ATAC-Seq 数据:
ChIP-Seq 技术服务:
https://www.biomart.cn/infosupply/40527259.htm
公司简介:
上海艾跃生物科技有限公司是Active Motif在中国设立的公司。Active Motif 专注于表观遗传和基因调控领域,开发和提供创新研究工具。我们致力于提供优质的产品,卓越的服务和支持。服务于生命科学,临床和药物开发领域用户。无论您是表观遗传研究领域的专家,或者只是希望整合表观遗传研究到您从事的研究领域,Active Motif 都能提供全面的产品和服务组合。我们的表观遗传学专家团队提供完整的,创新的解决方案,帮助您解决研究过程中遇到的问题。
单细胞ATAC-seq基于转座酶介导的测序引物插入开放的染色质区域。像普通的ATAC-Seq一样,该测定法提供了染色质开放和可及区域的轮廓。这些轮廓指示了单细胞分辨率下的活跃调控区域。
我们的scATAC-Seq服务可以同时检测数千个细胞的全基因组染色质可及性,从而可以检测异种群体中的细胞亚群,这种细胞亚群的信息会在普通ATAC-Seq中丢失。
ATAC-Seq能解决什么问题 ?
- 获取疾病或处理后基因调控,细胞反应的机制。
- 鉴定与细胞,疾病或反应相关的转录因子。
- 基于ATAC-Seq数据对不同疾病或样本组进行分类。
- 某些情况下可作为ChIP-Seq替代方案。如:不确定表观机制是否参与调控,不确定具体是哪一个组蛋白修饰参与调控,细胞数量受限。
ATAC-Seq技术服务包括:
1, 样本准备(组织或细胞)
2, Tn5酶切处理
3, 文库构建
4, 测序
5, 数据分析
Active Motif ATAC-Seq 发表文章(近年文章列表可下载文末附件):
Gulfem Dilek Guler.et al.Repression of Stress-Induced LINE-1 Expression Protects Cancer Cell Subpopulations from Lethal Drug Exposure,Cancer Cell,2017.07.002
Active Motif ATAC-Seq 数据:
ChIP-Seq 技术服务:
https://www.biomart.cn/infosupply/40527259.htm
公司简介:
上海艾跃生物科技有限公司是Active Motif在中国设立的公司。Active Motif 专注于表观遗传和基因调控领域,开发和提供创新研究工具。我们致力于提供优质的产品,卓越的服务和支持。服务于生命科学,临床和药物开发领域用户。无论您是表观遗传研究领域的专家,或者只是希望整合表观遗传研究到您从事的研究领域,Active Motif 都能提供全面的产品和服务组合。我们的表观遗传学专家团队提供完整的,创新的解决方案,帮助您解决研究过程中遇到的问题。
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