Alissa临床生物信息学平台

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语种：英文

作者：安捷伦

Alissa生物信息学平台分为两个模块：Alissa Align & Call（比对和识别模块），Alissa Interpret（变异报告模块）。

Alissa Align & Call为从原始数据到报告起草的整个过程提供生物信息学的准确度和速度。借助由 Agilent SureSelect、HaloPlex 和 OneSeq 文库和试剂共同创建的样品优化算法，Align & Call 可以解锁复杂的数据并加快获得结果的速度。在 NGS一体化工作流程中，Align & Call 的上游流程可以比对和识别变异以进行检测、注释和可视化，具有可扩展性，然后其 QC 评估和 VCF 文件可以轻松进入下游流程并在 Alissa 平台进行数据解析和报告。使用 Align & Call 的分析流程浏览从原始数据到变异识别的大型基因组数据，不需要复杂的 IT 架构或特殊硬件。Align & Call 作为完全托管的工作流程，可以轻松部署，而且安捷伦专家团队可以帮助您的实验室进行快速设置和扩展规模。Alissa Align & Call 将 Alissa 临床信息学平台上的变异评估和报告模块与下游无缝集成，使同一工作组内的所有用户能够轻松导出并浏览 QC 报告和 VCF 文件（需要所有账户全部订阅）。Align & Call 综合 QC 指标可确保 NGS 数据质量达到稳定工作流程的水平。Align & Call 的质量性能主要根据安捷伦的靶向序列捕获解决方案进行优化的算法，能够生成稳定的 SNP、插入和缺失、CNV 和 cnLOH 变异分析覆盖率指标，从而在不影响质量或准确度的前提下提高分析速度。

Alissa Interpret 使临床研究实验室能够高效分类、优化和报告基因组变异。无论数据来自 NGS 还是微阵列芯片，从变异的过滤和注释到优化和分类再到起草实验报告，该基因组数据管理解决方案可以让实验室的工作流程实现全面自动化。依靠专家团队可迅速部署新的检测方法，并随着您实验室研究规模的扩大提高您的研究水平。Alissa Interpret 基于临床研究实验室应用环境开发而成。该软件提供对大量注
释来源和数据库的访问，支持建立定制优化变异数据库，并为遗传模式、表型背景和变异影响检验提供各种深入的分析工具。Alissa Interpret 将CNV、SNP、插入和缺失以及融合基因结合到一个一体化的工作流程中。Alissa 将您的应用工作流程加以整合，从体细胞到遗传性疾病、从分子变异到结构变异，以及从二级数据分析到三级数据分析 ― 所有这些均可在单一平台上完成。

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