lncRNA测序

提供商 ：研载生物

服务名称 ：lncRNA测序

一、服务介绍 
长链非编码RNAs（long non-coding RNAs，lncRNAs）一般是指长度大于200 nt的RNA，位于细胞核内或胞浆中，不参与蛋白质编码功能，以RNA形式在多种层面上（表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等）调控基因的表达水平，在生命活动中具有重要作用。
长链非编码RNA测序（long non-coding RNA sequencing，lncRNA-Seq）是一种使用特定方法降低样本中rRNA 的丰度，对富集到的 RNA进行文库构建，再对高通量测序仪产出的数据进行信息分析的研究方法。lncRNA-Seq可一次性获得样本中几乎全部的lncRNAs信息，对lncRNAs的类别、功能进行全方位的深入分析，从而快速全面准确地获得与特定生物学过程（例如发育、疾病等）相关 lncRNA信息。
二、测序流程 
1.总RNA提取
2.片段化
3.去除tRNA
4.连接3’/5’接头
5.反转录
6.PCR扩增
7.文库定量
8.上机测序
9.数据质检
10 生物信息学分析
三、生物信息学标准化分析
已知lncRNA鉴定
计算已知lncRNA表达量及样品间lncRNA表达差异分析
预测新lncRNA
计算新lncRNA表达量及样品间新lncRNA表达差异分析
新lncRNA二级结构预测
四、样品要求 
1样品类型：细胞、新鲜组织或RNA样品。
2样品量：细胞样品请提供至少1×107个细胞，组织样品请提供至少300mg的组织块或切片，RNA样品请提供10 μg以上的总RNA。
3样品质量：RNA无明显降解，提取的总RNA OD260/280值在1.8~2.2之间，浓度≥ 500 ng/μl，28S:18S ≥ 1.5，RIN ≥7。
4样品保存：细胞样品或新鲜组织块（切成~50mg的小块）可用TRIZOL或RNA保护剂处理或液氮冻存后，-80℃保存。RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。
5样品运输：样品置于1.5 ml管中，封口膜封好，干冰运输。
五、质量承诺
提供可靠数据和分析结果。
 


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