核酸-蛋白相互作用技术

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核酸与蛋白互作不仅是生物有机体展示其生命活动的基本形式之一，还是核酸和蛋白功能阐释的重要内容。

核酸-蛋白互作研究按照实验内容可分为两大类，一是验证或筛选某条核酸序列（RNA或DNA）的结合蛋白，二是验证或筛选某个兴趣蛋白的结合RNA或DNA。

筛选蛋白基因片段
辉骏生物提供以下多种技术，帮助研究者们解析生物体内核酸与蛋白质之间的相互作用网络。

验证或筛选某条RNA/DNA的结合蛋白

技术类型	技术特点	适用样本
RNA pull-down	用生物素标记RNA，链霉亲和素磁珠捕获体外条件下结合的靶RNA-蛋白质复合物，Western Blot技术检测目的蛋白和靶RNA是否结合，或质谱技术鉴定复合物中的蛋白质成分	细胞
DNA pull-down	用生物素标记DNA，链霉亲和素磁珠捕获体外条件下结合的靶DNA片段-蛋白质复合物，Western Blot技术检测目的蛋白和靶DNA位点是否结合，或质谱技术鉴定复合物中的蛋白质成分	细胞
双荧光素酶检测启动子和转录因子的结合	将待测启动子构建到荧光素酶（Luc）基因上游，将构建好的Luc载体和转录因子表达载体共转染细胞，检测Luc活性，从而判断转录因子与目标启动子是否有相互作用	细胞

验证或筛选某个兴趣蛋白的结合RNA/DNA

技术类型	技术特点	适用样本
RIP	用诱饵蛋白抗体捕获体内条件下的诱饵蛋白与RNA复合物，采用qPCR技术检测诱饵蛋白与目的RNA是否结合，或采用高通量测序技术获得与诱饵蛋白结合的RNA序列	细胞
ChIP	用诱饵蛋白抗体捕获体内条件下的诱饵蛋白与DNA片段的复合物，采用qPCR技术检测诱饵蛋白与目的DNA位点是否结合，或采用高通量测序技术获得与诱饵蛋白结合的DNA位点序列	细胞