柱式粪便RNAout

柱式粪便RNAout

价格: ¥1680

品牌:上海雅吉生物科技有限公司

货号:101109-50

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产品详情

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库存 :1000

保质期 :1年

供应商 :上海雅吉生物科技有限公司

保存条件 :-20

规格 :50次

产品及特点
柱式粪便RNAout是在本公司柱式动物总RNA 快速提取试剂盒基础上升级的免氯仿产品,可用于从各种动物组织(包括白细胞)快速提取总 RNA。它具有下列特点:
1. 免去氯仿抽提步骤,操作更加简单快速,整个过程只需要不到十分钟(对
一个样品而言)。
2. 不使用有毒的氯仿,健康环保。
3. RNA 纯度很高,OD260/OD280 一般在 2.0 左右。
4. 一般不含用 RT-PCR 可以检测到的基因组 DNA 污染。
5. 适用于培养细胞、大部分动物组织和部分植物组织。
6. 所得 RNA 可直接用于 RT-PCR、Northern 杂交、cDNA 合成等实验。
7. 性价比高于进口的柱式 RNA 提取产品。
操作方法如下:
1. 操作简单快速,只要十分钟左右,可以全在室温下进行。
2. 所得 RNA 质量高,OD260/OD280 一般在 1.9,不含基因 DNA 污染。
3. 灵敏度高,可以从一个菌落中提取到普通电泳能够检测到的总 RNA。
4. 性价比高于进口同类产品。
规格及成分 成分 编号 100 次包装 250 次包装
细菌 RNAout 51102 100 mL 250 mL
使用手册 1 份



运输及保存 常温运输,4℃保存,有效期一年。
自备试剂 氯仿,异丙醇,75%乙醇,RNA 溶解液
柱式粪便RNAout使用方法 1. 在 1.5 mL 塑料离心管中离心收集 0.2-1.5 mL 新鲜细菌(注意:由于细菌RNA 半衰期十分短,所以,必须使用最新鲜细菌),吸尽液体培养基,加 入
1 mL 细菌 RNAOUT 并用枪充分吹打,确保细菌全部裂解,没有块状 物。如果使用菌落,则用接种环小心将其转移到装有 1 mL 细菌 RNAOUT 的
1.5 m 塑料离心管中,用移液枪吹打均匀。在细菌数较少时,建议使 用雅吉基因的助沉剂 RNADOWN 以提高 RNA 回收率。
2. 加入 0.2 mL 氯仿,在振荡器上充分振荡混均 30 秒(必须将管底的液体振荡起来,否则不能有效将 DNA 打断和去除蛋白质)。
3. 12000-15000 g 室温离心 3 分钟。上清液无色,下层液呈篮色,中间为 蛋白质。小心将上清液转移到另一干净 1.5 m 塑料离心管中,上清液体 积约为 0.6 mL。为避免触及中间层的 DNA 和蛋白质,建议分小量多次 吸
取,并且只取 0.5 mL,留 0.1 mL 左右。当细菌数量较少时,中间层 十
分松散,上清时很容易吸到下层有机相,需要更加小心。
4. 在上清液中加入等体积的异丙醇,振荡器上振荡混均 30 秒。
5. 12000-15000 室温离心 3-10 分钟,RNA 将在管底侧面形成沉淀。
6. 小心吸弃上清液,注意不要吸弃 RNA 沉淀。
7. 在离心管中加入 1mL 75%乙醇,振荡器上振荡混均 30 秒。
8. 12000-15000 g 室温离心 1 分钟。
9. 小心吸弃上清液,注意不要吸弃 RNA 沉淀。
10. 重复第 8 到第 10 步一次。
11. 短暂快速离心,用移液枪小心吸弃残留液(约 50 uL)。
12. 短暂放 1-2 分钟后加入适量 RNA 溶解液使 RNA 沉淀溶解,可以立即使用或存放于-80℃长期保存。
13. RNA 完整性的电泳检测:
如果需要做 Northern 杂交,强烈建议用户使用甲醛变性胶进行 RNA电泳,因为非变性胶不能分离所有的 RNA 分子(BioTechniques,28:414 , 2000 )。 如果是简单检测,可以使用 TAE 或雅吉基因的SuperBuffer-2 DNA/RNA 两用快速电泳液,但文献报道必须使用变性上样液(BioTechniques,9:558,1990)。普通 DNA 上样液不含变 性剂,也没经过去 RNase 处理,所以最好不要使用。 尤其需要注意的是不要使用 TBE 进行 RNA 电泳,因为 TBE 所含硼酸是研究多糖的经典方法----硼酸络合法中的关键成分,硼酸通过与 RNA 核糖中的羟基发生络合反应,形成 RNA 分子内或 RNA 分子间的络合复 合物,使同样长度的 RNA 具有
不同的泳动速度,电泳条带弥散,同时有大的 RNA 络合复合物迟留在加样孔中(一般会误以为是基因组 DNA 污染)。RNA 分子内或 RNA 分子间的络合物的形成的多少和比例又与硼酸与 RNA 的数量比例有关,而 RNA 样品中污染的其他多糖(如植物中提取的 RNA)也会参与此反应,使硼酸对RNA 电泳的影响更复杂,所以 TBE 对 RNA 电泳的影响没有规律性和重复性。有的样品可以使用有的又不行,最好是避免使用。
由于细菌细胞中 70-80%的 RNA 为 rRNA,后者又由 23S (约 3700nt),16S (约 1700 nt)和 5S (约 100 nt)三种组成,所以变性胶电泳后应
该 在 UV 下看见三条清晰的 rRNA 带。由于核酸长度与结合 EB 的数量成正比(当然还与 RNA 的二级结构有关,双链部分结合能力比单链部分强),
所以 23S rRNA 条带的荧光强度一般比 16S rRNA 条带的荧光强度强 2倍。如果这两条 rRNA 带不清晰或比例小于此范围则表示 RNA 有降解(因为大的 RNA 被酶降解的可能更大)。
14. RNA 产量产率测定:
将 5-10 μL RNA 溶于 TE 缓冲液中(pH7.5-8.2 之间)检测其在OD260 的光吸收。通过光吸收可以得出 RNA 浓度(1 OD260 的
RNA=40 μg/mL),进而计算出 RNA 的产量和产率。注意不要将 RNA 稀释在 DEPC 水中检测 OD260 和 OD280,否则光吸收比在 TE 中测得的低 10%-15%,因为核酸光吸收跟溶液 pH 相关,而 DEPC 水中的DEPC 高压分解后产生的 CO2 与水反应生成碳酸,使溶液 pH 降低进而降低 RNA 的光吸收。
15. RNA 纯度测定:
无污染的总 RNA 的 OD260/OD280 一般在 1.8-2.1 之间(具体数值与其碱基组成和溶液成分等多种因素有关), OD260/OD230 一般在2.0-2.3 之间,如果低于或高于此范围则分别表示样品可能有蛋白质或多糖
的污染,但一般不影响 RT-PCR 等反应。蛋白质污染可以通过酚/氯仿抽提一次然后酒精沉淀去除,DNA 和多糖污染可以分别用雅吉基因的 DNAErasol 和 PS Erasol 去除。
疑难解答 Q:上样孔里的红色荧光物一定是污染的基因组 DNA 吗?
A:不是。用 TAE 或 TBE 电泳液和非变性胶电泳 RNA 时容易产生此现象,雅吉基因初步研究发现大部分红色荧光物是变性不充分的单链RNA通过碱基
互补或通过硼酸络合(如果使用 TBE 作电泳液的话)形成的复合物,加 RNase处理后,这些红色荧光物一般会消失。为避免此现象,建议最好使用甲醛变性胶电泳。如果需要使用非变性胶,也必须在上样前使 RNA 变性。使用雅吉基因优化的上样/变性/染色三用溶液 RNAON 可以使 RNA 在非变性胶上电泳时也有较 好分 辨率 。使用 非变性 胶时 ,可以使用 TAE 或超快 电泳 液SuperBuffer-2,最好不要使用 TBE 缓冲液,因为 TBE 中的硼酸能与 RNA的多羟基形成复合物,RNA 很难形成锐利的条带。
Q:如何确认和去处除污染的基因组 DNA?
A:如果怀疑有 DNA 污染,可以用 RNase 处理 RNA 样品,然后再电泳。如果上样孔里的红色荧光物不消失,则表示是基因组 DNA 污染。进一步确认可以使用 PCR 扩增法。去除污染的 DNA 可以使用非酶的 DNA 去除剂DNA
Erasol 或 RNase-free DNase,由于 RNase-free DNase 一般都有残留的RNase 污染,所以必须严格按照厂家提供的使用手册进行操作。
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 温馨提示:不可用于临床治疗。

 

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