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文献和实验
相关推荐
服务名称 :双萤光素酶检测,6折大促
提供商 :OBiO和元生物
规格 :6折大促
双萤光素酶检测服务
1、双萤光素酶报告系统介绍:
双萤光素酶报告基因检测系统:在细胞中同时表达萤火虫萤光素酶(Firefly luciferase简称F-Luc)和海肾萤光素酶(Renilla luciferase简称R-Luc),F-Luc作为报告基因反应目的基因表达的改变,R-Luc作为内参基因,为试验提供一基准线(减少内在变化因素如培养细胞的数目,细胞转染和裂解的效率对实验准确性的影响)。所构成的报告系统广泛用于基因调控、非编码RNA靶向互作等研究领域。
2、 应用介绍
2.1 靶基因验证
实验原理
miRNA主要通过作用于靶基因的3’UTR起作用(降解或抑制翻译),将目的基因3’UTR(野生型和结合位点突变型)序列构建至载体中报告基因F-Luc的3’端,通过比较过表达miRNA后,报告基因表达的改变(萤光素酶的活性下降还是不变),来确定miRNA与靶基因3’UTR的作用位点。
双萤光素酶报告基因检测系统:在细胞中同时表达萤火虫萤光素酶(Firefly luciferase简称F-Luc)和海肾萤光素酶(Renilla luciferase简称R-Luc),F-Luc作为报告基因反应目的基因表达的改变,R-Luc作为内参基因,为试验提供一基准线(减少内在变化因素如培养细胞的数目,细胞转染和裂解的效率对实验准确性的影响)。所构成的报告系统广泛用于基因调控、非编码RNA靶向互作等研究领域。
2、 应用介绍
2.1 靶基因验证
实验原理
miRNA主要通过作用于靶基因的3’UTR起作用(降解或抑制翻译),将目的基因3’UTR(野生型和结合位点突变型)序列构建至载体中报告基因F-Luc的3’端,通过比较过表达miRNA后,报告基因表达的改变(萤光素酶的活性下降还是不变),来确定miRNA与靶基因3’UTR的作用位点。
案列介绍
题目: Tumor-derived exosomal miR-1247-3p induces cancer-associated fibroblast activation to foster lung metastasis of liver cancer
期刊: Nature communications
小结:验证B4GALT3(β-1,4-半乳糖基转移酶III)基因具有miR-1247-3p的靶向结合位点。将B4GALT3预测结合位点的序列克隆到报告基因载体,同时构建靶位点突变的载体,分别共转miR-1247-3p mimics及NC mimics,结果显示转染miR-1247-3p 的WT组相对荧光值降低,MUT组不变,提示存在靶向结合。
题目: Tumor-derived exosomal miR-1247-3p induces cancer-associated fibroblast activation to foster lung metastasis of liver cancer
期刊: Nature communications
小结:验证B4GALT3(β-1,4-半乳糖基转移酶III)基因具有miR-1247-3p的靶向结合位点。将B4GALT3预测结合位点的序列克隆到报告基因载体,同时构建靶位点突变的载体,分别共转miR-1247-3p mimics及NC mimics,结果显示转染miR-1247-3p 的WT组相对荧光值降低,MUT组不变,提示存在靶向结合。
相关实验:miRNA同lncRNA/circRNA靶向互作
2.2 转录因子结合位点及启动子活性验证
实验原理
转录因子主要通过作用于靶基因的启动子起作用,将目的基因启动子区序列替换报告基因F-Luc的启动子,通过共表达转录因子后,报告基因表达的改变,来确定转录因子与靶基因启动子结合位点及对靶基因的作用。
2.2 转录因子结合位点及启动子活性验证
实验原理
转录因子主要通过作用于靶基因的启动子起作用,将目的基因启动子区序列替换报告基因F-Luc的启动子,通过共表达转录因子后,报告基因表达的改变,来确定转录因子与靶基因启动子结合位点及对靶基因的作用。
案列介绍
题目:Invasion of white matter tracts by glioma stem cells is regulated by a NOTCH1-SOX2 positive-feedback loop
期刊:Nature neuroscience
小结:验证Sox9在Sox2启动子区有多个结合位点,构建不同的启动子片段到报告基因载体中,共表达Sox9,显示插入片段的缩短和推测结合位点的减少,荧光素酶活性也随之下调。
题目:Invasion of white matter tracts by glioma stem cells is regulated by a NOTCH1-SOX2 positive-feedback loop
期刊:Nature neuroscience
小结:验证Sox9在Sox2启动子区有多个结合位点,构建不同的启动子片段到报告基因载体中,共表达Sox9,显示插入片段的缩短和推测结合位点的减少,荧光素酶活性也随之下调。
3、常见应用方向总结
(1)验证miRNA同mRNA靶向互作。将靶mRNA的3’UTR序列插入报告基因载体,再共转入该miRNA,如果萤光素酶活性下降,则提示为其靶序列。
(2)验证miRNA同circRNA靶向互作。将circRNA序列插入报告基因载体中F-Luc的3’UTR区域,检测萤光素酶活性。
(3)验证miRNA同lncRNA靶向互作。将lncRNA序列插入报告基因载体中F-Luc的3’UTR区域,检测萤光素酶活性。
(4)启动子活性分析。将启动子区域序列进行分段截短,再分别构建入报告基因载体,检测其启动子活性。
(5) 验证特定转录因子同启动子的作用。将启动子区域插入报告基因载体,同时在实验细胞中共转该转录因子,分析转录因子过表达是否提高萤光素酶活性。
(6)分析信号通路是否激活。将该信号通路的下游响应原件序列构建入报告基因载体,在不同上游信号条件下,萤光素酶活性代表了通路的下游响应。
4、技术路线:
根据实验目的设计实验方案—预测结合位点--构建野生/突变报告基因载体系统---共转染细胞---检测酶活
客户提供:
1.启动子转录活性调控:提供转录因子名称及ID、靶基因名称及ID。
2. miRNA靶基因验证:提供miRNA名称、物种信息、靶基因名称及ID。
3.实验细胞,如无特殊要求,和元默认使用293T细胞。
(1)验证miRNA同mRNA靶向互作。将靶mRNA的3’UTR序列插入报告基因载体,再共转入该miRNA,如果萤光素酶活性下降,则提示为其靶序列。
(2)验证miRNA同circRNA靶向互作。将circRNA序列插入报告基因载体中F-Luc的3’UTR区域,检测萤光素酶活性。
(3)验证miRNA同lncRNA靶向互作。将lncRNA序列插入报告基因载体中F-Luc的3’UTR区域,检测萤光素酶活性。
(4)启动子活性分析。将启动子区域序列进行分段截短,再分别构建入报告基因载体,检测其启动子活性。
(5) 验证特定转录因子同启动子的作用。将启动子区域插入报告基因载体,同时在实验细胞中共转该转录因子,分析转录因子过表达是否提高萤光素酶活性。
(6)分析信号通路是否激活。将该信号通路的下游响应原件序列构建入报告基因载体,在不同上游信号条件下,萤光素酶活性代表了通路的下游响应。
4、技术路线:
根据实验目的设计实验方案—预测结合位点--构建野生/突变报告基因载体系统---共转染细胞---检测酶活
客户提供:
1.启动子转录活性调控:提供转录因子名称及ID、靶基因名称及ID。
2. miRNA靶基因验证:提供miRNA名称、物种信息、靶基因名称及ID。
3.实验细胞,如无特殊要求,和元默认使用293T细胞。
和元生物技术(上海)股份有限公司
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