DNA甲基化测序价格_品牌:-丁香通官网

服务名称：DNA甲基化测序

提供商：武汉爱基百客生物科技有限公司

全基因组DNA甲基化测序（WGBS）

技术原理
全基因组DNA甲基化测序结合了硫酸氢盐转化（Bisulfite conversion）方法与新一代高通量测序技术，可在单碱基分辨率水平上高效的检测全基因组DNA甲基化的状态。

技术路线

技术优势
1.分辨率高：分辨率达到单碱基，是DNA甲基化检测的金标准；
2.效率高：彻底检测基因组所有C碱基，获取全面信息；
3.应用范围广：适用于所有具有参考基因组的物种，适于进行开创性工作。

信息分析流程
1）数据过滤：对原始数据进行过滤，获得Clean Data；
2）PE reads拼接：使用软件FLASH将成对的reads拼接成Tag；
3）Tags聚类成OTU，并对OTU进行PCA、韦恩图、Rank曲线等分析；
4）通过数据库比对对OTU进行物种注释，绘制物种profiling柱状图、热图及系统进化树；
5）基于OTU聚类分析结果，对样品进行Alpha多样性分析；
6）基于OTU聚类分析及物种注释结果，对样品间复杂度比较，进行 Beta 多样性及聚类分析；
7）基于物种注释结果，找出组间导致样品差异的物种。

信息分析内容

样品要求
1）DNA样本
1.样品纯度：OD260/OD280=1.8~2.0，A260/A230≥1.6；无蛋白、多糖和RNA污染；
2.样品完整性：DNA无明显降解，需提供凝胶电泳检测胶图；
3.样品溶剂：建议样品用高质量试剂盒提取，溶于ddH₂O，确保试剂内不含有影响酶活的酒精、苯酚等其他有机试剂。
2)血液样本
1.送样前处理：要求为全血样本，并加入抗凝剂（非肝素），无血凝块，冷冻后，干冰运输送样；
2.送样标准：全血≥3mL。
3）组织样本
1.送样前处理：活体取材后的组织需用0.9%生理盐水漂洗，以去除血渍和污物，并剔除结缔组织和脂肪组织等非研究所需的组织类型，吸干，并将样品分割成50mg左右的小块（组织块越小，保存效果越好），放入1.5 mL或者2.0 mL的EP管中，液氮速冻后用封口膜封口，再将EP管放置于50mL离心管中或封口袋中，于-80℃超低温冰箱冻存；
2.送样标准：每个样本新鲜组织干重≥2g；若样本为非新鲜组织，DNA得率会降低，建议多送些样本。

项目周期
4个样品以下为40个工作日，4个样品以上根据实际情况确定时间。