​Goldengate自定义SNP分型芯片

服务名称 ：​Goldengate自定义SNP分型芯片

提供商 ：北京晶典生物科技有限公司

Goldengate自定义SNP分型芯片
服务简介
Illumina公司的Goldengate定制芯片平台是理想的中等通量自定义芯片技术平台，可根据客户提供的单核苷酸多态性位点SNP的rs号、基因名称、序列或要研究的区域的位置进行生物信息学分析，挑选SNP位点并进行位点实验成功率评分，评分结果返回用户处后和用户沟通一起来确定要进行研究的SNP位点，以合成探针组（OPA），进行基因分型的研究。一个样本可以同时进行几十上百个SNP位点的研究，可以满足不同研究对低、中通量或者多重基因分型的要求。
 
Goldengate自定义SNP分型芯片技术流程
（1）DNA激活。DNA样本首先要进行激活，以便结合到顺磁颗粒（生物素或链亲和素）上。
（2）杂交。寡核苷酸、杂交缓冲液和顺磁粒子结合到激活的DNA上。杂交之后，进行多次洗脱，去掉多余或未杂交的寡核苷酸，降低噪音。
（3）延伸连接。正确匹配的ASO进而延伸，与LSO延伸的产物连接。
（4）连接产物作为模板，可用通用PCR引物（p1,p2,p3）进行扩增。P1和p2用Cy3- 、 Cy5-标记。
（5）单链下游延伸。
（6）通过特异的序列，带有染料标记的DNA与互补的微珠结合。
（7）洗脱，干燥。
（8）用BeadArray Reader读取芯片上的荧光信号，软件依次分析，自动得出基因型。  
技术特点
（1）低成本的中等通量基因分型解决方案。
（2）每张芯片可进行最低48重、最高1536重SNP位点反应，可同时进行96样本的SNP检验，定制灵活。
（3）方法经典可靠，检测重复性>99%，准确性高。
 
服务内容
    本公司根据客户提供的SNP列表、基因列表或者感兴趣区域，设计和定制个性化的Goldengate芯片进行SNP分型。
 
样本要求
总量：1-100个位点，≥1μg DNA；超过100个位点，≥2 μg DNA；
浓度：≥50 ng/μL；
纯度：OD_260/280=1.8-2.0，OD_260/230=1.0-3.0