RNA 甲基化课题设计思路

价格： ¥1

产品详情

相关推荐

提供商：上海英拜生物科技有限公司

RNA 甲基化修饰约占所有 RNA 修饰的 60% 以上，而 N6- 甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine,m6A）是高等生物mRNA和lncRNAs上最为普遍的修饰。目前发现microRNA，circRNA,rRNA,tRNA和snoRNA上都有发生m6A修饰。 m6A修饰主要发生在RRACH序列中的腺嘌呤上，其功能由“编码器(Writer)”、“消码器(Eraser)”和“读码器(Reader)”决定[1]。“编码器(Writer)”即甲基转移酶，目前已知这个复合物的成分有 METTL3，METTL14, WTAP和KIAA1429；而ALKBH5 和FTO作为去甲基酶（消码器）可逆转甲基化；m6A由m6A结合蛋白识别，目前发现m6A结合蛋白（读码器）有YTH结构域蛋白（包括YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3， YTHDC1 和YTHDC2）和核不均一蛋白HNRNP 家族（HNRNPA2B1 和 HNRNPC）。
m6A 的研究方向（1）主要是通过研究 m6A 修饰相关的甲基化、去甲基化酶和识别蛋白的功能，进而研究 m6A 修饰的生物学功能和作用机制：一般通过敲除 m6A 酶分子，研究下游功能基因分子的表达和 m6A 甲基化情况，通过介导相关基因异常（可变剪切、稳定性、翻译、miRNA 调控）影响细胞表型和功能特征。（2） m6A 修饰图谱构建及作用机制：通过 m6A 甲基化测序（MeRIP-Seq,miCLIP）构建疾病细胞模型或者发病组织的 m6A 修饰谱，分析 m6A 的 motif,peaks 数量及分布，Peak 关联基因的特征，联合 RNA-seq 研究 m6A 甲基化与表达的关系。
m6A研究思路
疾病样本vs正常样本 3vs3以上 MeRIP‐Seq RNA‐Seq m6A修饰图谱分析 m6A修饰差异基因分析差异表达基因分析差异表达基因关联分析 MeRIP‐PCR、qPCR验证