微生物群落结构及多样性分析 16sRNA/DGGE

服务名称 ：微生物群落结构及多样性分析服务

提供商 ：北京众智领先科技有限公司

细菌16S rDNA 是细菌染色体上编码16S rRNA 的DNA 序列，存在于所有细菌染色体基因中，其序列能够显示细菌间不同分类等级水平上的特异性，适用于细菌亲缘关系的研究，并可作为测量细菌进化和亲缘关系的良好工具，同时可以利用可变区序列的差异对不同菌属、菌种的细菌进行分类鉴定。
真菌18S rDNA/ITS序列是真菌染色体上能够用于进行亲缘关系研究，测量真菌进化和亲缘关系的工具，同样可以利用基因可变区序列的差异对不同菌属、菌种真菌进行分类鉴定。
通过构建细菌16S rDNA 序列、真菌18S/ITS序列分析可以分析某一特定环境中微生物群落结构和细菌多样性，对于研究微生物与环境的关系、环境治理和微生物资源利用有着重要的理论和现实意义。

服务内容：
克隆文库分析：
PCR 方法扩增特定环境样品中细菌16S rDNA或真菌18S rDNA/ITS，使用TA 克隆方法构建克隆文库，挑选阳性克隆测定基因序列，并与GenBank 中已知序列进行同源性比较，获得特定环境中的微生物群落结构和多样性信息。
T-RFLP末端限制性酶切片段分析：
PCR 方法扩增特定环境样品中细菌16S rDNA或真菌18S rDNA/ITS，采用T-RFLP 限制性内切酶对扩增产物进行限制性酶切，利用DNA分析仪分析末端限制性酶切片段，获得末端限制性酶切片段长度，峰高及面积等信息，PAT数据库分析比对获得特定环境中的微生物群落结构及多样性信息。
DGGE 变性梯度凝胶电泳分析：
PCR 方法扩增特定环境样品中细菌16S rDNA或真菌18S rDNA/ITS，通过变性梯度凝胶电泳分析环境样品中微生物菌群落结构；将凝胶电泳条带回收后克隆测序，确定微生物种属关系，获得特定样品中的微生物多样性信息。
高通量测序MiSeq分析：
采用第二代高通量测序平台MiSeq，对核糖体RNA高变区域，比如16S rDNA/18S rDNA/ITS等序列，或功能基因，比如细菌和古菌的氨氧化酶基因进行测序，揭示环境样品中众多不同类型微生物种属关系，获得特定样本中的微生物多样性信息。

需要提供的信息：

1. 环境样本或环境DNA 样本。
2. 环境样品及其中的细菌是否具有致病性和潜在危险，如您对样品具有一定的致病性或均有潜在的危险，请您提供样本DNA。
3. 请您提供选择何种方式进行微生物群落结构和细菌多样性进行分析。

服务周期：
40个工作日左右。

实验结果：
提供给您DNA电泳检测图，需测序样本的测序峰图，序列比对结果及完整的结果分析报告。

客户须知：
本技术服务需要签订服务合同。
本服务完成后，实验样品为您保存1月，一月后将统一销毁。