BSA性状关联分析

产品简介

混池测序是基于集群分离（Bulked Segregant Analysis，BSA）策略实现对目标性状的定位研究。在分离群体中，通过对发生性状分离的子代个体分别混成两个样本池进行测序，利用高性能计算平台和生物信息学方法，计算影响性状的候选区域以及相应的突变位置和突变类型，实现对目标性状的快速定位，加速作物育种改良。

应用领域

•质量性状位点定位；

•QTL-seq定位数量性状位点；

•Mutmap定位诱变位点；

产品优势

•性价比高：测序文库少，周期短，准确性高；

•分析全面：针对候选基因筛选进行详细的分析；

•丰富的物种经验：甘蔗、油菜、桃、水稻等。

技术路线

分析内容

标准信息分析

与参考基因组比对:比对率和覆盖度分析；

SNP、InDel检测及注释:开发SNP、InDel标记；

子代SNP、InDel频率差异分析:寻找有差异的SNP、InDel位点。

高级信息分析

目标性状区域定位:找到与目标性状关联的区域；

候选基因提取和功能注释：获得候选基因及基因功能。

样品要求

1.样品类型：基因组DNA（混池测序）；

2.样品需求量：单次2 ug；

3.样品浓度：文库≥30 ng/µl；

4.样品纯度：OD260/280为1.8-2.0；

5.电泳要求：主带清晰，无降解或轻度降解。（距送样日最近的电泳结果）