遗传图谱

产品简介

遗传图谱（genetic map），又叫连锁图谱（linkage map），根据重组交换定律，将标记之间的重组交换率定义为二者之间的相对距离构建标记的线性图谱。随着标记密度的增加，一条染色体会形成一个连锁群。基于这样的特点，通过构建高密度的SNP标记连锁图，能辅助基因组de novo组装到染色体水平，同时通过连锁群之间的共线性分析以及连锁群与物理图谱的共线性分析进行比较基因组学的研究，以揭示基因组在进化过程中所发生的重大结构变异。遗传图谱最适合用于QTL定位，通过对作图群体进行测序和连锁作图，结合表型数据定位控制目标性状QTL。

应用领域

•QTL（数量性状位点）定位；

•辅助基因组组装；

•比较基因组学研究。

产品优势

•亲本高深度+子代低深度方式构建高密度遗传图；

•显著降低图谱构建和QTL定位的时间和劳力成本；

•可用于多种亲本间差异性状的QTL定位；

•丰富的物种经验：油菜、油茶、水稻等。

技术路线

分析内容

标准信息分析

测序数据质量评估；

与参考基因组比对；

与拟参考基因组比对（无参）；

群体SNP检测及注释；

遗传标记开发及过滤；

遗传图谱构建及质量评估；

高级信息分析

目标性状QTL定位:找到与目标性状关联的区域；

候选基因提取和功能注释：获得候选基因及基因功能；

辅助物种基因组组装；

比较基因组学研究。

样品要求

1.样品类型：基因组DNA；

2.样品需求量：单次2 ug；

3.样品浓度：文库≥30 ng/µl；

4.样品纯度：OD260/280为1.8-2.0；

5.电泳要求：主带清晰，无降解或轻度降解。（距送样日最近的电泳结果）