宏转录组测序

服务名称 ：宏转录组测序

提供商 ：南京集思慧远生物科技有限公司

产品简介：

宏转录组学（Metatranscriptomics）兴起于宏基因组之后，从整体水平上研究某一特定环境，特定时期群体生命全部基因组转录情况以及转录调控规律。它以生态环境中的全部RNA为研究对象，避开了微生物分离培养困难的问题，能有效的扩展微生物资源的利用空间。2006年，Leiniger等首次使用454测序技术对一个复杂微生物群落的宏转录组进行研究。与宏基因组学相比较，宏转录组学能从转录水平研究复杂微生物群落变化，能更好的挖掘潜在的新基因。

技术优势

◆ 宏转录组研究采用先进的测序平台。

◆ 高通量覆盖可全面检测生态环境中的微生物信息。

◆ 充分挖掘样品中存在的微生物多样性及动态变化情况。

◆ 广泛应用于肠道内容物、土壤、水体等研究中。

技术路线：

分析内容：

测序数据质量评估：过滤掉低质量数据，保证数据质量

基因预测：基因预测及相关性分析

物种、功能注释：物种、基因功能注释及相关分析

CAG(Co-abundance genes)：疾病和菌株关联研究

CNV(copy number variation) 菌株拷贝数变异与疾病关联研究

ARDB：耐药基因相关分析

噬菌体：噬菌体及前噬菌体预测及分析

样品要求：

1. 样品类型：总RNA；

2. 样品浓度：≥200 ng/ul；

3. 样品总量：≥3ug；

4. 样品纯度：OD260/280为1.8~2.2，OD260/230≥1.0；无基因组DNA污染；