古朵生物阐述:质粒DNA提取实验

古朵生物阐述:质粒DNA提取实验

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服务名称 :质粒DNA提取

提供商 :上海古朵生物科技有限公司

标签: 质粒 DNA 提取 古朵生物 培养基

注意:以下技术资料仅参考!

质粒DNA提取可以:(1)快速纯化质粒;(2)用于测序、体外转录与翻译、限制性内切酶消化、细菌转化等分子生物学实验。

一、实验方法:
碱解法:
实验方法原理
质粒多为一些双链、环状的DNA分子,是独立于细菌染色体之外进行复制和遗传的辅助性遗传单位。质粒是进行分子生物学实验操作,进行遗传工程改良物种等工作时最主要的DNA载体。

提取质粒的基本步骤分为三步:
①细菌的培养和质粒的扩增
②细菌菌体的裂解
③质粒DNA的纯化

SDS碱裂解法(试剂盒提取):
实验方法原理
碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA的方法,碱变性抽提质粒DNA是基于染色体DNA与质粒DNA的变性与复性的差异而达到分离目的。在pH值高达12.6的碱性条件下,染色体DNA的氢键断裂,双螺旋结构解开而变性。质粒DNA的大部分氢键也断裂,但超螺旋共价闭合环状的两条互补链不会完全分离,当以pH4.8的NaAc/KAc高盐缓冲液去调节其pH值至中性时,变性的质粒DNA又恢复原来的构型,保存在溶液中,而染色体DNA不能复性而形成缠连的网状结构,通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA、蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。

简明原理:碱裂解法是基于DNA的变性与复性差异而达到分离目的的。碱性使质粒DNA变性,再将pH值调至中性使其复性,复性的为质粒DNA,而染色体DNA不会复性,缠结成网状物质,通过离心除去。

二、技术详解
质粒dna的提取是DNA技术中的必备实验技能。质粒DNA上携带的基因信息可经过基因表达实验后表现出相应的性状。质粒DNA的分离提取包括了培养细胞——收集——分离纯化三大步骤。

质粒是细胞内的一种环状的小分子DNA,是进行DNA重组的常用载体。作为一个具有自身复制起点的复制单位独立于细胞的主染色体之外,质粒dna上携带了部分的基因信息,经过基因表达后使其宿主细胞表现相应的性状。在DNA重组中,质粒或经过改造后的质粒载体可通过连接外源基因构成重组体。

从宿主细胞中提取质粒DNA,是DNA重组技术中最基础的实验技能。分离质粒DNA有三个步骤:

1、培养细菌使质粒扩增

2、收集和裂解细菌

3、分离和纯化质粒DNA

碱裂解法是较常用的提取的方法。其优点是得率高,适合于大多数的和菌株,所得产物经纯化后可满足多数的DNA重组操作。此法采取酸碱度高达Ph12.6的碱溶液使DNA发生变性。由于质粒和主染色体的拓扑结构不同,变性时前者虽然两条链分离,但仍然缠绕在一起不分开;而后者完全变性分,甚至出现断裂。因此,当加入中和液时,溶液Ph值恢复较低的近中性水平,此时, 质粒的两条小分子单链可迅速复性,恢复双链结构,但是主染色体DNA则无法复性。在离心时,大部分主染色体与细胞碎片,杂质等缠绕一起被沉淀,而可溶性的质粒DNA留在上清夜中。

在质粒提取过程中,由于机械力、酸碱度、试剂等的原因,可能使质粒DNA链发生断裂。所以,多数质粒粗提取物中含有三种构型的质粒:

共价闭合环状DNA(cccDNA): 质粒的两条链没有断裂;超螺旋

开环DNA(ocDNA): 质粒的一条链断裂;松弛的环状分子

线形DNA(lDNA): 质粒的两条链均断裂;线性分子

质粒DNA提取

三、材料、试剂及器具

1、材料

E.coliDH 5α(pUC 19 vector)

2、试剂

1)LB培养基

2)TE缓冲液

3)裂解液:溶液Ⅰ、溶液Ⅱ、溶液Ⅲ

4)酚:lvfang:异戊醇(25:24:1)

5)无水乙醇

6)70%乙醇

7)氨苄青霉素50mg/mL

器具

离心机、离心管、吸嘴

四、操作步骤

以1%比例把E.coliDH5α(含PUC18)接种于含氨苄青霉素(Amp)100μg/ml)的LB培养基中37℃振摇过夜(12-18h)



取1.5ml培养物置离心管中



10000rpm,离心1min,或4000rpm,离心5-10min



去上清,倒扣干净吸收纸上吸干



沉淀+100μL溶液Ⅰ



加或不加入少量溶菌酶粉末;混匀,室温放置10min



+加200μL溶液Ⅱ(新鲜配置)



温和颠倒数次,混匀,冰上放置5min



+150μl溶液Ⅲ→颠倒混匀,冰上放置15min



离心12000rpm,15min



上清液+等体积酚:lvfang:异戊醇振匀,12000rpm,离心5min



小心转移上层至一新的离心管弃下层有机相和中层蛋白质



上清液+2倍体积无水乙醇混匀,室温5min-10min



12000rpm,5min-15min

↓弃上清

沉淀+1mL70%乙醇



12000rpm离心5min-15min



弃上清;并倒扣离心管使液体流干

↓+

自然干燥或真空抽干(看不到液滴为宜)



加50μlTE缓冲液(20μg/mlRNaseA)溶解质粒粗取物



-20℃保存

五、实验报告

检查、保存提取的质粒,要求记录实验现象并说明原因。

六、注意事项
1. Buffer S2、Buffer S3和Buffer W1含刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套和眼镜,避免沾染皮肤、眼睛和衣服,谨防吸入口鼻。若沾染皮肤、眼睛时,要立即用大量清水或生理盐水冲洗,必要时寻求医疗咨询。

2. 本试剂盒为AxyPrep 质粒DNA小量试剂盒,适合于从1-4 ml 细菌培养物中提取多至20 μg 高纯的质粒DNA。

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