全转录组测序-欧易生物

全转录组测序

全转录组是指某个物种或特定的细胞在某一功能状态下转录产生的所有 RNA 的总和，包括 mRNA 和非编码RNA。与常规转录组测序相比，全转录组测序是通过去除 rRNA 进行的建库和测序，可以同时获得 mRNA、lncRNA 和 circRNA 三种类型的 RNA 信息。大多数lncRNA 和circRNA能在转录及转录后水平上调控基因表达，在多种生物过程中发挥了重要作用，并与疾病的发生密切相关。全转录组测序在研究 mRNA 的同时，能够发现大量的 lncRNA和circRNA，并对其表达水平和转录本结构进行分析，进一步开展 lncRNA、circRNA 与 mRNA 的关联分析，即可深入研究 lncRNA和circRNA 的调控网络。

服务优势

丰富的建库经验，优秀的建库质量
多年文库构建技术沉淀，具有复杂样品处理能力和丰富的建库经验；

临床数据质量与数量完美结合
CLIA 认证实验室，5S 实验规范管理，多套计算集群，保证数据产出质量和分析速度，助力诸多客户发表上千篇高水平文章；

专业个性化的生物信息分析
专业成熟的生物信息分析团队，结合客户的需求，灵活进行定制化信息分析；

特色高级分析
针对 mRNA、lncRNA 和 circRNA 的全面分析，IncRNA调控机制预测，ceRNA分析，GSEA和GSVA等。

结果展示


图 | 差异基因聚类热图
说明：横轴表示样本，纵轴表示差异mRNA/lncRNA/circRNA，红色表示相对高表达基因，蓝色表示相对低表达基因



图 | lncRNA cis调控分析图


应用案例

医学案例：
英文标题：Circular RNA circRNF13 inhibits proliferation and metastasis of nasopharyngeal carcinoma via SUMO2
中文标题：环状RNA circRNF13通过SUMO2抑制鼻咽癌的增殖和转移
发表期刊：Molecular Cancer
影响因子： 27.401
关键词：全转录组测序；circRNA靶基因预测；鼻咽癌；
doi: 10.1186/s12943-021-01409-4