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服务名称 ::高通量测序服务- circRNAs(circular RNAs,环形RNA分子)
提供商 :南京世和基因生物技术有限公司
规格 :样
高通量测序服务- circRNAs(circular RNAs,环形RNA分子)
circRNAs(circular RNAs,环形RNA分子)是一类不具有5'末端帽子和3'末端poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子。circRNA主要来源于内含子或外显子,在mRNA前体分子可变剪接加工过程中通过反向拼接或套索内含子的方式产生,具有进化上保守、结构稳定以及组织表达特异性等特征。circRNA在真核细胞中大量存在,相比于线性RNA分子,环状circRNA对RNase不敏感,稳定性更高,进化上高度保守且有组织表达特异性。近年研究发现,circRNA具有很多重要的调控功能,例如,circRNA可以作为竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)结合胞内miRNA,阻断miRNA对其靶基因的抑制作用。除此以外,circRNA也具有调控其他类型RNA、调节蛋白质活性等功能。目前circRNA的研究还处于前期阶段,nature、cell等顶尖期刊发表的研究成果显示circRNA在疾病诊断和治疗方面具有巨大潜力,研究意义重大。
一、服务平台以及技术路线:
二、服务相关-样品要求
样品类型 | 总RNA样品。 |
样品量 | 20μg以上的总RNA。 |
样品质量 | RNA无明显降解,提取的总RNA,OD260/280值在1.8~2.2之间,浓度≥500 ng/μL,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥ 7。 |
样品保存 | RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。 |
样品运输 | 置于1.5 mL管中,封口膜封好,干冰运输。 |
三、生物信息学分析内容
- 数据质量评估及过滤
- 基因组比对与统计
- 环状 RNA鉴定与预测
- 环状RNA 注释
- 环状RNA分布统计(长度、在基因组染色体上的分布等)
- 环状RNA表达定量
- 样品间环状RNA表达差异分析
- 差异基因GO分析和Pathway富集分析
- circRNA-miRNA-mRNA关联分析
公司简介:
世和基因是癌症个体化医疗诊断及高通量测序行业的先行者与领航者,2008年末一批在生物医药领域有突出贡献的北美华人科学家开始致力于高通量全景癌症基因测序的研究。世和基因生物技术团队由多名多伦多大学,哈佛大学,斯坦福大学,新加坡国立大学,北京大学及NIH博士和专家组成,专注于高通量测序、癌症生物学、生物信息学领域并拥有丰富的分子遗传研究及临床转化经验。 世和基因依托雄厚的技术实力与世界顶级综合性医院、大学、研究所携手生命科学领域研究,共同推进基础研究向临床成果转化。同时,世和基因科研团队在科研立项、投稿、沟通、修改上处于国际领先水平,至今已发表高影响因子文献(20分以上)近10篇,并拥有数项核心专利。
世和优势:
1. 严格的质量把控
世和基因的测序流程在符合国际标准的临床实验室开展,执行最严格的质量监控,完善的实验流程管理,智能化LIMS报告系统。
2. 高稳定的数据输出
使用illumina原厂进口测序试剂,配备了高通量测序所需的整套分子生物学设备。世和基因在碱基准确度、测序均一性、可用数据比例等方面的质量标准均全球遥遥领先。我们不仅承诺lane/flow cell/run 的总数据量,还承诺测序数据的Q30。
3. 多样化的测序平台
世和基因拥有HiSeq X, HiSeq 4000, MiSeq, NextSeq 500等测序仪,多种测序平台保证了项目的快速进行及灵活性。
4. 强大的技术支持与生物信息分析团队
丰富的基因组项目及处理不同样品的经验,技术支持由国际名校的博士团队承担,强大的生物信息团队可针对不同项目进行深入分析与数据挖掘,保证提供最优最新最全的解决方案。
5. 价格优势及短周期
世和基因致力于不断降低顾客的测序成本,缩短测序周期。我们承诺提供优于同行的测序价格和测序周期。
世和基因中国总部
南京世和基因生物技术有限公司
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