甲基化测序（Whole Genome BS-Seq， WGBS）价格

服务名称：甲基化测序（Whole Genome BS-Seq， WGBS）

提供商：南京世和基因生物技术有限公司

规格：样

世和基因--高通量测序服务专家
高通量测序服务- 甲基化测序（Whole Genome BS-Seq， WGBS）

2016年，世和基因引进10台HiSeq X “超级” 测序平台，致力于成为全球领先的基因组学研究解决方案提供者，专注于动植物生命科学，临床转化医学，人类健康，及药物研发等领域的开发应用。现在公司高通量测序平台包括 10 台 HiSeq X、HiSeq 4000、MiSeq、NextSeq 500等平台，可满足临床诊疗业务及科研业务不同需求，是基因组学的首选合作伙伴。HiSeq X Ten是Illumina公司推出的最高通量，最高效率，最低成本的测序系统，首次实现了将人类基因组重测序成本降低到了1000美金以下。HiSeq X Ten由10台超高通量测序仪HiSeq X组成，系统单台仪器每次运行可产出高达1.8Tb的数据，测序读长为2×150b，运行时间为三天以内。10台仪器同时运行时，每年可完成可超过18000个人类基因组重测序（30×覆盖度）。因此，HiSeq X Ten系统将使研究人员更易于开展大规模人类基因组测序，并将有利于深入挖掘与癌症及复杂疾病相关的遗传变异。
DNA甲基化对生命活动非常重要，是基因调控的手段之一（即通过对位于启动子及第一外显子区的CpG岛的甲基化而抑制基因的表达），是表观遗传学研究的热点。DNA甲基化是由DNA甲基转移酶（DNA methyl-transferase, Dnmt）催化，以S-腺苷甲硫氨酸（SAM）作为甲基供体，DNA上的胞嘧啶被选择性地添加甲基，形成5－甲基胞嘧啶。通常，DNA的甲基化会抑制基因表达。DNA的甲基化状态对染色体的结构维持、X染色体失活、基因印记以及胚胎发育、正常细胞功能维持，乃至疾病、癌症发生都是十分重要的。现在甲基化测序有三种：
组甲基化测序（Whole Genome BS-Seq， WGBS）是将重亚硫酸盐（Bisulfite）处理方法和Illumina高通量测序平台Hiseq X Ten相结合，对有参考基因组信息的物种进行全基因组范围内的甲基化水平的测序。可以精确到单碱基分辨率，精确分析每一个C碱基的甲基化状态，从而构建全基因组甲基化图谱。全基因组重亚测序达到全基因组覆盖, 是研究甲基化水平的“金标准”。
观亚硫酸氢盐测序技术（Reduced Representation Bisulfite Sequencing， RRBS)先用MspI酶切处理，该酶的酶切位点为CCGG，从而将CpG位点富集出来，之后再进行bisulfite处理实现C与mC的单碱基区分，最终用较小的数据量得到包含最多CpG位点甲基化信息的单碱基精度的甲基化图谱。RRBS由于经过了Bisulfite 处理，凭借着其单碱基分辨率，能够精确评估覆盖区域的甲基化水平。再加上酶切打断的原理，该方法的覆盖范围具有良好的重复性和稳定性；并且能通过酶切位点过滤部分降解片段对结果的影响。但是RRBS 的覆盖范围被酶切位点所限制，只能覆盖基因组的部分区域，主要集中在promoter 和CpG island 等富含CpG 的区域。在疾病研究中，Promoter 的甲基化状态与基因表达、性状表型息息相关，RRBS 作为一种关注CpG-rich 区域的甲基化研究方法，能够避免过多的数据浪费，更有针对性的研究覆盖区域的甲基化状态，使得大样本量单碱基分辨率的甲基化差异研究成为可能。
合蛋白测序（Methylated DNA Binding Domain-Sequencing, MBD-Seq）是利用特异性结合高甲基化DNA的蛋白富集高甲基化的DNA，再用高通量测序技术对富集得到的DNA进行测序的方法。从而检测全基因组范围内的甲基化位点。该技术可以特异性的对基因组内发生甲基化修饰的区域进行检测，适用于遗传印记、胚胎发育、肿瘤发生发展等研究。

一、服务平台以及技术路线：

全基因组甲基化测序化简化表观亚硫酸氢盐测序甲基结合蛋白测序

二、服务相关-样品要求

样品类型	DNA 样本
样品量	≥ 10ug DNA
样品质量	OD260/280值在1.8～2.0 之间；保证基因组无降解，浓度≥100 ng/μL。
样品保存	溶于TE或者双蒸水，样品必须注明溶剂成分.
样品运输	样品置于1.5 mL管中，封口膜封好，低温寄送样品或干冰邮寄。

三、生物信息学分析内容

数据质量评估及过滤
基因组比对分析，基因组覆盖度分析
基因组甲基化图谱分析
全基因组 mC附近碱基的序列特征分析
基因甲基化分析及功能注释
差异性甲基化区分析（DMR）
差异基因GO分析和Pathway富集分析

公司简介：

世和基因是癌症个体化医疗诊断及高通量测序行业的先行者与领航者，2008年末一批在生物医药领域有突出贡献的北美华人科学家开始致力于高通量全景癌症基因测序的研究。世和基因生物技术团队由多名多伦多大学，哈佛大学，斯坦福大学，新加坡国立大学，北京大学及NIH博士和专家组成，专注于高通量测序、癌症生物学、生物信息学领域并拥有丰富的分子遗传研究及临床转化经验。世和基因依托雄厚的技术实力与世界顶级综合性医院、大学、研究所携手生命科学领域研究，共同推进基础研究向临床成果转化。同时，世和基因科研团队在科研立项、投稿、沟通、修改上处于国际领先水平，至今已发表高影响因子文献（20分以上）近10篇，并拥有数项核心专利。

世和优势：

1. 严格的质量把控

世和基因的测序流程在符合国际标准的临床实验室开展，执行最严格的质量监控，完善的实验流程管理，智能化LIMS报告系统。

2. 高稳定的数据输出

使用illumina原厂进口测序试剂，配备了高通量测序所需的整套分子生物学设备。世和基因在碱基准确度、测序均一性、可用数据比例等方面的质量标准均全球遥遥领先。我们不仅承诺lane/flow cell/run 的总数据量，还承诺测序数据的Q30。

3. 多样化的测序平台

世和基因拥有HiSeq X， HiSeq 4000, MiSeq, NextSeq 500等测序仪，多种测序平台保证了项目的快速进行及灵活性。

4. 强大的技术支持与生物信息分析团队

丰富的基因组项目及处理不同样品的经验，技术支持由国际名校的博士团队承担，强大的生物信息团队可针对不同项目进行深入分析与数据挖掘，保证提供最优最新最全的解决方案。

5. 价格优势及短周期

世和基因致力于不断降低顾客的测序成本，缩短测序周期。我们承诺提供优于同行的测序价格和测序周期。

世和基因中国总部