Hi-SNP中高通量基因分型

服务名称 ：Hi-SNP中高通量基因分型

提供商 ：上海英拜

基本原理
Hi-SNP结合多重PCR技术和高通量测序技术，对需要检测的位点设计特异性引物，在单管内进行多重PCR扩增，不同的样本以不同的Barcode引物区分。混合样本后，在Ion Proton/Ion Torrent平台上，对扩增子进行高通量测序。测序结果使用生物信息学方法，区分不同的样本，最终获得每个位点的SNP信息。高通量测序能一次对几百万条DNA分子进行序列测定，相比其他的SNP检测技术，基于高通量测序的SNP分型具有更准确、更灵敏的特点。

应用领域
本方法适用于很多的遗传学研究领域，例如疾病基因组研究、肿瘤基因组研究、疾病与基因的关联研究、临床分子诊断研究等，在植物基因组研究中，可用于QTL定位及分子育种，非常适合大规模样品的SNP分析。

服务流程
1、确认实验信息，评估实验可行性
2、样本质控，设计合成引物探针
3、小试、中试，建立实验方案
4、PCR生产，构建高通量测序文库
5、上机测序
6、生物信息学分析，出具实验报告

提供结果
1、实验报告，包括实验材料、方法、引物等等
2、结果汇总，即基因分型结果（excel形式）
3、统计分析（可选）






样本要求
1、若分型样品为基因组DNA，要求：DNA浓度≥20ng/ul，体积>20ul。纯度OD 260/OD280 在1.8～2.0之间。
2、若分型样品为血样，样本要求：血液样品，体积大于500ul，需用抗凝剂抗凝，送样过程中请注意保持低温，防止DNA降解。提取DNA将收取DNA提取费。
3、寄送样品时，应在送样包裹中放置足量的冰袋或干冰，以减少在运输过程中因温度变化导致DNA降解的可能。
4、提供SNP位点信息，人类基因组需SNP位点的rs号；其它物种如牛、鸡、鱼等无rs号的，需SNP位点上下游各250bp的确切序列，SNP位点的突变类型，以及位点的上下游25bp内是否存在其它位点。

服务优势
1、 Hi-SNP单次实验可以得到数百万条序列，能够同时对上千个样本数百个位点进行检测，具有高通量、高灵敏的特点
2、 实验严谨，分区操作，加石蜡油防止气溶胶污染，各个环节保证实验准确性
3、 可以配合LDR技术，方案灵活，性价比高