细胞染色质免疫共沉淀(ChIP)试剂盒-20T

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文献支持细胞染色质免疫共沉淀(ChIP)试剂盒-20T

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规格 :20T

万类生物试剂促销:试剂盒8折优惠,细胞染色质免疫共沉淀(ChIP)-20T 原价2135元,现价1708元。


产品名称:细胞染色质免疫共沉淀(ChIP)试剂盒

产品概述:染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation assay, ChIP)作为最佳的研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法,它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。
 
注意事项:
1. 甲醛固定时,时间不宜过长,10min即可。
2. 超声时温度不能过高,最好冰浴进行;防止样品起沫。
3. 样品中加入填料后离心转数不能过大,防止填料破碎。
4. 蛋白酶抑制剂使用前室温融化。

该产品被引用文献(仅展示部分):

1、 Pan M; Luo M; Liu L, et al., EGR1 suppresses HCC growth and aerobic glycolysis by transcriptionally downregulating PFKL. J Exp Clin Cancer Res 2024, 43 (1), 35.

IF: 11.3 Year: 2024 PMID:38287371

2、 Zhang W; Wang Q; Xing X, et al., The antagonistic effects and mechanisms of microRNA-26a action in hypertensive vascular remodelling. Br J Pharmacol 2021, 178 (5), 1037-1054.

IF: 7.73 Year: 2020 PMID:33305374

3、 Zhang X; Liu L; Liu X, et al., Chidamide suppresses adipogenic differentiation of bone marrow derived mesenchymal stem cells via increasing REEP2 expression. iScience 2023, 26 (3), 106221. 

IF: 6.107 Year: 2023 PMID:36879811


操作流程:
1. 每皿细胞(9ml 培养液),加入243µl 37%甲醛,使得甲醛的终浓度为1%,室温培养10min。
2. 终止交联:加1M 甘氨酸1.26ml,使其终浓度为0.125M,室温培养5min。
3. 吸尽培养基,用预冷的PBS洗两次后,加适量蛋白酶抑制剂(2ml PBS中加入5µl 蛋白酶抑制剂),用细胞刮收集细胞,2000rpm,4℃离心5min。
4. 弃上清,加入1ml Buffer A,冰上放置10min,3000-5000rpm离心5min。
5. 弃上清,加入400µl Buffer B(每100µl Buffer B中含有106细胞)重悬后加入5µl 蛋白酶抑制剂。
6. 超声破碎。一般来说,300W超声10s,间隔30s,12次。12000rpm,4℃离心20min。取20µl上清电泳检测,抹带集中在500-1000bp左右即可。
7. 样品分成三组,每组100µl,A:实验组; B:阳性对照组;C:阴性对照组,剩余样品可放置-80℃保存。
8. 在三组样品中分别加入900µl Chip Diluiton Buffer。
9. 准备ProteinA beads,用1ml PBS 清洗三次(3000rpm离心1min)后保存备用,此步可提前准备。
10. 三组样品中各加入60 µl ProteinA beads, 4℃颠倒混匀1-2h。
11. 混匀后4℃静置10min,3000rpm离心1min。
12. 取上清,每组样品取20µl 进行 Input实验,-20℃保存。
13. 实验组中加入1-10µg 抗体;阳性对照组加入1µg RNA Polymerase II抗体;阴性对照组加入1µg 正常血清IgG,4℃过夜孵育。
14. 三组样品中再加入60µl ProteinA beads, 4℃颠倒混匀1-2h。
15. 洗涤ProteinA beads 依次用下列溶液清洗沉淀复合物。清洗步骤为:加入1ml 预冷溶液,在4℃混匀10min,3000rpm离心1min,除去上清。
a. Low Salt Wash Buffer,1次。
b. High Salt Wash Buffer,1次。
c. LiCl Wash Buffer,1次。
d. TE Buffer,2次。
16. 每管加入100µl Elution Buffer(100µl 10%SDS+100µl 1M NaHCO3+800µl ddH2O),室温颠转10min后3000rpm离心1min,收集上清。重复洗脱1次,终体积200µl。
17. 取出Input实验样品,室温融化后加入180µl Elution Buffer。
18. 解交联。每管中加入8µl 5M NaCl,混匀,65℃解交联过夜。
19. 解交联结束后,每管加入1µl RNaseA,37℃孵育1h。
20. 每管加入4µl 0.5M EDTA,8µl 1M Tris-HCl(PH=6.5),1µl Proteinase K,45℃孵育2h。
21. DNA片段回收(WLA092a PCR纯化试剂盒)。
22. 对照品的PCR。
23. 取出每种PCR反应物10μl,采用4%琼脂糖凝胶电泳(采用100bp DNA marker)进行分析。

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