数据非依赖性采集(DIA)定量技术

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服务名称 :数据非依赖性采集(DIA)定量技术

数据非依赖性采集(DIA)定量技术
数据非依赖性采集( Data independent acquisition,DIA)定量技术,将整个质谱扫描质量范围分为若干窗口,依次对每个窗口的所有离子进行碎裂,采集全部子离子信息。该技术无需指定目标肽段,扫描点数均匀,利用谱图库即可实现定性确证和定量离子筛选,同时可实现数据回溯。

应用领域
适用于多生物样本中的蛋白质组非标定量比较,差异蛋白质的发现。

技术优点:
1.相比DDA技术的非标定量结果,定量重现性和准确度更高。
2.定量蛋白质通量高,能同时实现3000-4000个蛋白质的定量。

检测仪器
QE-HF, Fusion,Lumos

分析流程:
样品经胰酶酶切后,采用常规DDA质谱检测技术分析建立图谱库,之后采用DIA方法进行质谱数据采集。定量数据采用Skyline或Spectronaunt软件处理。

可选择数据分析:
1.蛋白质/肽段鉴定及定量结果
2.差异蛋白质统计分析
3.蛋白质GO分析及差异蛋白GO富集分析
4.蛋白质Pathway通路分析及差异蛋白的
Pathway通路分析
5.多样品间表达模式聚类分析(适用于样
本数≥3的项目)

样品要求:
蛋白提取物:≥50 μg
细胞:≥106
组织:动物组织≥1 mg,植物组织≥10 mg
体液:血清≥5μL,脑脊液≥10μL









参考文献:
1 Egertson JD, MacLean B, Johnson R, Xuan Y, MacCoss MJ.Multiplexed peptide analysis using data-independent acquisition and Skyline. Nat Protoc. 2015 Jun;10(6):887-903.
2 Egertson JD, Kuehn A, Merrihew GE, Bateman NW, MacLean BX, Ting YS, Canterbury JD, Marsh DM, Kellmann M, Zabrouskov V, Wu CC, MacCoss MJ. Multiplexed MS/MS for improved data-independent acquisition. Nat Methods. 2013 Aug;10(8):744-6.
3 张 伟,Reiko Kiyonami, 江 峥,陈 伟. 创新数据非依赖性采集用于复杂基质目标蛋白质的定量分析.分析化学.2014, 42(12):1750-8.
4张 伟.定量蛋白质组学质谱采集技术进展.分析化学.2014, 42(12):1859-68.

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