Label-free 蛋白质组非标记定量技术

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Label-free样本无需标记，直接采用液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，通过比较质谱信号强度和谱图计数，来分析不同来源样本蛋白量的变化。

应用领域：
1.动植物组织或细胞、微生物、体液的蛋白组鉴定和相对定量；
2.Pull-down方法或免疫沉淀方法富集的蛋白鉴定和相对定量。

技术优点：
1.所需样本量少，可对微量样本进行分析，不受样本数量限制；
2.检测动态范围可以达到4个数量级以上，提高了低丰度蛋白质的检测效率；

分析流程
样品经Trypsin 酶切，酶切产物由高精度质谱分析，数据由
Mascot等软件进行分析。

可选数据分析
1.数据产出统计；
2.蛋白质鉴定及定量结果；
3.蛋白质GO分析及差异蛋白GO分析；
4.蛋白质Pathway通路分析及差异蛋白的Pathway通路分析；
5.重复性分析（仅针对有重复设计的项目）；
6.多样品间表达模式聚类分析（适用于样本数≥3的项目）。

样品要求
蛋白提取物：≥50μg
细胞：≥10⁶
组织：动物组织≥1mg,植物组织≥10mg
体液：血清≥5μL，脑脊液≥10μL

参考文献
1、Zhu W, J.W. Smith, and C.M. Huang. Mass spectrometry-based label-free quantitative proteomics.J BIOMED BIOTECHNOL. 2010; 2010: p. 840518.
2、Ding C, Jiang J, Wei J, et al. A fast workflow for identification and quantification of proteomes,Mol Cell Proteomics. 2013 Aug;12(8):2370-80.
3、Niemann M, Wiese S, et al. Mitochondrial outer membrane proteome of Trypanosomabrucei reveals novel factors required to maintain mitochondrial morphology. Mol Cell Proteomics. 2013; 12(2): 515-28.
4、Vanderschuren H, Nyaboga E, et al. Large-Scale 2、Cholewa BD, Pellitteri-Hahn MC, et al. Large-Scale Label-Free Comparative Proteomics Analysis of Polo-Like Kinase 1 Inhibition via the Small-Molecule Inhibitor BI 6727 (Volasertib) in BRAFV600E Mutant Melanoma Cells. J Proteome Res. 2014 Jun 9.
5、Proteomics of the Cassava Storage Root and Identification of a Target Gene to Reduce Postharvest Deterioration. Plant Cell. 2014.