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文献和实验
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服务名称 :iTRAQ
提供商 :美吉生物
美吉生物拥有一流的液质联用平台、实力雄厚的技术团队和国际一流的生物信息分析团队、可以给您提供专业。合理和高性价比的技术方案和服务。产品介绍
应用领域
- 机理和调控机制研究 动态过程中机制研究
- 疾病标志物的筛选,用药及预后标志物筛选
实验流程
分析流程
送样指导
样品类型 | 样品要求(/组样品) | 备注 |
蛋白质溶液 | 蛋白质总量≥300µg | 重复实验则量翻倍,建议准备两份样品备用。 |
组织样品 | 样品总量≥0.1g | 按照蛋白质组织提取效率(蛋白:组织=7%) |
细胞样品 | 细胞数量≥107个 | 胰酶消化,按细胞冻存标准离心收集细胞即可。 |
体液样品 | 血清≥200µL,脑脊液≥200µL,尿液≥1mL ,泪液≥1mL. |
经典案例
精神错乱患者的患者的脑脊液中的蛋白质表达含量变化
利用iTRAQ蛋白质组学相对定量方法,探讨精神错乱的发病机制。通过iTRAQ方法分析17类精神错乱患者的脑脊液中的蛋白质表达含量变化,一共鉴定并定量到了270个脑脊液中蛋白质:16个在大多数精神错乱患者中异常表达;一部分蛋白质与认知程度和精神错乱严重程度相关;这些结果为后期精神错乱的机制研究及诊断提供了参考。
参考文献:
Poljak, A., et al. (2014) Quantitative proteomics of delirium cerebrospinal fluid. Translational psychiatry 4, e477.
常见问题
1、iTRAQ定量蛋白质组实验完成后,能拿到什么结果,是否可以直接用来发文章?
我们目前的iTRAQ定量蛋白质组的实验流程和结果都是受到业内顶级杂志JPR和MCP认可的,可以直接用于文章的发表。客户不仅可以拿到iTRAQ定量蛋白质组中的差异蛋白、蛋白的GO和KEGG归类信息、COG归类、不同样本的差异蛋白的聚类分析、差异蛋白的互作蛋白信息等,还可以提供客户指定的分析内容,提供个性化的服务要求,比如转录组和蛋白质组的关联分析。
2、iTRAQ技术有什么优势?有什么缺陷?
该技术的优势:多达8标记、系统误差小、直接对二级谱定量、定量蛋白数量更多、标记效率高等。
该技术的缺陷:应该说这是唯一的缺陷,就是定量不是当前定量技术最准确的,最准确的是SWATH和MRM技术。定量不准确的原因是附近m/z同位素的干扰,这些m/z接近的同位素引入了干扰的4标记或8标记的同位素,最终导致原本差异10倍,而干扰会将10倍变成5倍左右。当然,差异蛋白的趋势是正确的,大量发表的研究论文也证实了这一点。
3、目前贵公司iTRAQ技术采用什么型号的质谱仪?数据分析使用什么软件?
目前是我们使用的仪器包括AB Sciex公司的Triple TOF 5600,分析软件为配套的proteinpilot;Thermo Fisher 的Q-Exactive, Orbitrap Fusion™ Tribrid™,分析软件为ProteomeDiscoverer。
上海美吉生物医药科技有限公司
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