转录组测序（mRNA-seq）

转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA 和非编码RNA（即Non-coding RNA，如 tRNA，rRNAs，microRNAs，piRNAs和 long ncRNAs等）。转录组是连接基因组遗传信息与生物功能的必然纽带，转录组研究已经成为揭示生物生长发育调控和逆境胁迫适应机制、生物进化规律、疾病发生发展的重要机制以及发现致病基因调控的关键靶点等方面的最佳研究手段。近年来，随着测序成本的不断降低和测序通量的飞跃提升，第二代测序技术凭借高准确性、高通量、高灵敏度和低运行成本等突出优势逐渐成为解决生物学问题不可或缺的手段。
　　
　　转录组测序（Transcriptome sequencing）主要通过高通量测序研究特定组织或细胞在某个时期转录出来的mRNA。
　　
　　样品提供：　　
　　1、类型： Total RNA。　　
　　2、样品量：真核：总量≧1.5ug；原核：总量≧1.5ug。　　
　　3、样品浓度：真核：浓度≧50ng/ul；原核：浓度≧65ng/ul。　　
　　4、样品纯度：OD260/280≧1.8；28S/18S≧1。　　
　　5、RNA完整性：植物、真菌 RIN值≧6.5；动物 RIN值≧7.0；原核 RIN值≧6.0。
　　6、组织样品：动物、植物、微生物总量大于500 mg的新鲜样品(植物材料应尽量选取幼嫩部位)。采样后将样品立即用RNAlater和液氮速冻，保存于-80℃(保存期不超过一个月)，送样时使用干冰运输(不超过72 h)；提取RNA后经变性电泳，保证各RNA条带清晰、比例适中、完整性好、无降解。特别要求样品分成3份，方便后续提取，避免同一份样品反复冻融造成样品降解。

7、细胞样品：先使用TRIzol试剂进行处理，于-80℃保存，并提供2-3份该样品。原则上不接收未经TRIzol处理的细胞样品。

　　服务内容：　　
　　1、数据mapping，mRNA表达量的分析。　　
　　2、microRNA数据mapping，已知microRNA表达量的分析。　　
　　3、小RNA数据过滤掉已知microRNA，protein-coding region, repeat sequences, rRNA, tRNA, snRNA, and snoRNA，再做未知microRNA预测及表达量的分析。　　
　　4、根据表达量信息和表型信息，找到表型相关的mRNA和microRNA，或者是差异表达的mRNA和microRNA。　　
　　5、差异表达mRNA进行聚类、GO富集及KEGG富集分析（上调、下调统计），网络整合分析。　　
　　6、差异表达microRNA作用的靶mRNA的预测。　　
　　7、既是差异表达microRNA的靶mRNA，又是差异表达mRNA，这类mRNA进行聚类、GO富集及KEGG富集分析（上调、下调统计），网络整合分析。
　　
　　具体价格请咨询QQ：2594263399　　
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