细菌小RNA测序

细菌小RNA测序

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服务名称 :细菌小RNA测序

提供商 :云序生物

细菌小RNA(sRNA)是一类长度在50~300 nt的调控RNA, 与细菌生长、代谢、应激反应、致病性密切相关。细菌sRNA多通过与靶mRNA配对, 在转录后水平影响目标mRNA翻译或稳定性,影响细胞的多种生理功能。云序生物为客户提供一站式细菌小RNA测序服务,能够帮助客户识别新的细菌小RNA,解析细菌小RNA表达谱,预测细菌小RNA的靶基因,促进其功能和机制研究。

云序特色
  • 适用的细菌种类全面:云序生物拥有市面上最全的去rRNA试剂盒,能够去除各类细菌样品中的rRNA,高效地检测小RNA分子
  • 特异性富集小RNA特异性富集50-300 nt的小RNA片段,sRNA有效数据比例高
  • 链特异性检测:链特异性建库方案,可以准确检测反义sRNA
  • 专业的生物信息学分析:强大的生物信息学团队,满足客户的各类深入数据分析需求

数据分析
基本分析 高级分析
1. 原始数据整理,过滤和质量评估 CS-BSR-001. sRNA靶基因预测
2. 序列匹配与数据统计 CS-BSR-002. sRNA靶基因的GO与信号通路分析
3. sRNA识别和注释 CS-BSR-003. sRNA-靶基因相互作用网络
4. sRNA表达量计算
5. 差异sRNA筛选
6. sRNA表达聚类分析

数据展示

上图:sRNA分类统计

云序生物技术服务列表
1. 测序服务
转录组 表观遗传组 基因组
真核生物 原核生物
miRNA测序 细菌sRNA测序 (h)MeDIP测序 目标序列靶向测序
小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA) 原核生物mRNA测序 RRBS测序 外显子组测序
lncRNA测序 宏转录组测序 全基因组甲基化测序 人类基因组重测序
环状RNA测序 原核生物转录组测序 ChIP测序 16S rDNA测序
mRNA测序 原核De novo转录组测序 RNA pull down 宏基因组测序
降解组测序 RIP测序
转录组测序 RNA甲基化测序
De novo转录组测序

2. 生信服务 & PCR技术服务
生信服务 实时定量PCR服务
转录组 表观遗传组 基因组 联合分析
环状RNA分析 DNA甲基化分析 基因组分析 circRNA-miRNA 功能分型PCR芯片
lncRNA分析 ChIP测序分析 微生物菌落分析 LncRNA-mRNA 环状RNA实时定量PCR
mRNA分析 宏基因组分析 LncRNA-miRNA-mRNA LncRNA实时定量PCR
microRNA分析 miRNA实时定量PCR
mRNA实时定量PCR

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