de novo转录组测序

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服务名称 :de novo转录组测序 - 真核生物

提供商 :云序生物

目前,还有大量物种没有参考基因组序列信息,针对这些物种必须通过De novo转录组拼接获取其转录组基本信息。通过拼接的结果可以进一步对转录本进行功能注释、差异筛选、SNP分析等,为下一步的研究提供指引。

云序特色
  • 链特异性检测:链特异性的建库方案,可以准确检测反义RNA,提供更全面的转录组信息。
  • 专业化的生物信息分析:强大的生物信息学团队,满足客户的各类深入数据分析需求

数据分析
基本分析 高级分析
1. 原始数据整理,过滤和质量评估 CS-ETN-001. Unigene GO功能注释
2. De novo转录组组装和拼接 CS-ETN-002. Unigene信号通路分析
3. 拼装结果统计和分析 CS-ETN-003. Unigene COG功能注释
4. Unigene注释 CS-ETN-004. LncRNA预测
5. Unigene表达分析
6. Unigene差异表达分析

数据展示
上图:差异mRNA的top 10 GO条目

云序生物技术服务列表
1. 测序服务
转录组 表观遗传组 基因组
真核生物 原核生物
miRNA测序 细菌sRNA测序 (h)MeDIP测序 目标序列靶向测序
小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA) 原核生物mRNA测序 RRBS测序 外显子组测序
lncRNA测序 宏转录组测序 全基因组甲基化测序 人类基因组重测序
环状RNA测序 原核生物转录组测序 ChIP测序 16S rDNA测序
mRNA测序 原核De novo转录组测序 RNA pull down 宏基因组测序
降解组测序 RIP测序
转录组测序 RNA甲基化测序
De novo转录组测序

2. 生信服务 & PCR技术服务
生信服务 实时定量PCR服务
转录组 表观遗传组 基因组 联合分析
环状RNA分析 DNA甲基化分析 基因组分析 circRNA-miRNA 功能分型PCR芯片
lncRNA分析 ChIP测序分析 微生物菌落分析 LncRNA-mRNA 环状RNA实时定量PCR
mRNA分析 宏基因组分析 LncRNA-miRNA-mRNA LncRNA实时定量PCR
microRNA分析 miRNA实时定量PCR
mRNA实时定量PCR

上海云序生物科技有限公司

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