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文献和实验
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服务名称 :lncRNA测序
提供商 :云序生物
长链非编码RNA(Long non-coding RNA,LncRNA)是一类长度超过200nt,不编码蛋白质的RNA分子。这类RNA分子在表观遗传水平、转录水平以及转录后等水平调控基因的表达,广泛参与各种生理学过程,与癌症、心血管疾病、神经退行性疾病等多种人类疾病密切相关。目前,LncRNA已经取代miRNA成为近几年来最耀眼的明星RNA分子,是国际上的研究热点。云序生物提供的LncRNA测序服务同时分析特定样品中的所有LncRNA和mRNA,并根据已知数据库和文献对LncRNA进行详细注释,能够帮助客户筛选与特定生物学过程或疾病相关的LncRNA,并为后续的LncRNA功能和机制研究提供极大的便利。
云序特色
- 全面检测所有LncRNA:约有20%的LncRNA没有Poly(A)尾巴,如果采用Oligo d(T)富集法会丢失这部分LncRNA信息。云序生物拥有市面上最全的,针对不同物种的去rRNA试剂盒,能够保留所有LncRNA信息
- 适用于降解样品:采用特有的、可适用于降解样品的去rRNA试剂盒,能够最大程度地保留降解样品中的LncRNA信息。尤其适合于临床样品的LncRNA检测
- 链特异性检测:采用链特异性建库方法,可准确检测反义LncRNA,提供最全面的LncRNA信息
- 专业化的生物信息学分析:强大的生物信息学团队,满足客户的各类深入数据分析需求
数据分析
基本分析 | 高级分析 |
1. 原始数据整理,过滤和质量评估 | CS-LNC-001. LncRNA靶基因共表达网络分析(CNC) |
2. 基因组匹配与数据统计 | CS-LNC-002. LncRNA靶基因集信号通路富集分析(LncRNA-GSEA) |
3. LncRNA识别和注释(含mRNA) | CS-LNC-003. LncRNA临近靶基因GO和信号通路分析 |
4. LncRNA表达量计算(含mRNA) | CS-LNC-004. LncRNA-miRNA-mRNA互作网络分析 |
5. 差异LncRNA筛选(含mRNA) | CS-LNC-005. LncRNA上游转录因子分析 |
6. 差异mRNA的GO和信号通路分析 | CS-LNC-006. 新LncRNA预测 |
CS-LNC-007. LncRNA分子标志物筛选 |
数据展示
上图:LncRNA-miRNA-mRNA网络图
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云序生物技术服务列表
1. 测序服务
2. 生信服务 & PCR技术服务
生信服务 | 实时定量PCR服务 | |||
转录组 | 表观遗传组 | 基因组 | 联合分析 | |
环状RNA分析 | DNA甲基化分析 | 基因组分析 | circRNA-miRNA | 功能分型PCR芯片 |
lncRNA分析 | ChIP测序分析 | 微生物菌落分析 | LncRNA-mRNA | 环状RNA实时定量PCR |
mRNA分析 | 宏基因组分析 | LncRNA-miRNA-mRNA | LncRNA实时定量PCR | |
microRNA分析 | miRNA实时定量PCR | |||
细菌sRNA分析 | mRNA实时定量PCR | |||
宏转录组分析 |
上海云序生物科技有限公司
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