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文献和实验
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提供商 :上海旭燃生物科技有限公司
服务名称 :宏基因组测序|
产品简介
宏基因组学(Metagenomics)研究通过全基因组鸟枪法(Whole Genome Shotgun,WGS)测序策略,将提取获得的微生物组总DNA随机打断为短片段,并构建合适长度的插入片段文库,对这些文库进行双端(Paired-end,PE)高通量测序,从而能精细地展示整个菌群的功能代谢谱和物种精细组成谱,进而在组成和功能水平分别挖掘关键生物标记物,从原理上阐明微生物群落在生态系统中发挥作用的根本机制。
产品特点
1.可以直接获得微生物功能基因的相对丰度
2.基于已知物种,鉴定分辨率可达物种、甚至菌株水平
3.不需要微生物群落相关的先验知识(如捕获噬菌体、病毒、质粒以及微小真核生物等)
4.基本不会产生PCR偏好性
5.可以估算有参考基因组微生物的原位生长速率
6.可组装获得群体平均基因组(甚至可以获得其中一些微生物较完整的基因组)
7.可以挖掘新的基因家族。
2.基于已知物种,鉴定分辨率可达物种、甚至菌株水平
3.不需要微生物群落相关的先验知识(如捕获噬菌体、病毒、质粒以及微小真核生物等)
4.基本不会产生PCR偏好性
5.可以估算有参考基因组微生物的原位生长速率
6.可组装获得群体平均基因组(甚至可以获得其中一些微生物较完整的基因组)
7.可以挖掘新的基因家族。
数据分析
分析内容
部分分析结果展示
应用场景
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上海旭燃生物科技有限公司
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