qPCR（miRNA/lncRNA/circRNA）

什么是lncRNA和miRNA？

他们都来自一个大家庭：非编码RNA（non-coding RNA）。

先说微小RNA（micro RNA, miRNA），MicroRNAs (miRNAs)是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA，是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成，不同于siRNA（双链）但是和siRNA密切相关。据推测，这些非编码小分子RNA参与调控基因表达，但其机制区别于siRNA介导的mRNA降解。第一个被确认的miRNA是在线虫中首次发现的lin-4 和let-7，随后多个研究小组在包括人类、果蝇、植物等多种生物物种中鉴别出数百个miRNAs。
lncRNA是对应长链非编码RNA的一个集合概念，是较高级真核生物（其实也没多高级，昆虫也有）细胞转录组中长度超过200nt，且不编码蛋白翻译的线性RNA，包括pseudogene和long intergenic non-coding RNA(lincRNA)等，它们与mRNA相比还有一些其他特征，比如有的没有cap或polyA（鬼知道它们怎么活下来的），很多存在二级结构且通过其发挥功能，还有大部分具有组织特异性等。lncRNA的功能多种多样，概括地讲就是作为庞大的物质基础和背景，协调完成高等生命复杂的调控过程，所以那些经典的例子如HOTAIR或H19，细分都是属于lincRNA的范畴。
lncRNA因其存在Introns等片段组成，长度可达数千nt，这就为吸附结合大量的miRNA提供了良好的物质基础，通过竞争占有胞内大量的miRNA，像海绵一样缓冲并削减其干涉靶基因mRNA编码蛋白的能力，我们就称这样的lncRNA与mRNA互为竞争性内源RNA（ceRNA）关系，因此可见，作为关联节点的就是miRNA，它的靶构成了ceRNA，共同组合就是ceRNA网络。众多研究中，对抑癌基因PTEN相关ceRNA调控机制的认识较为成熟。

 

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miRNA

miRNA是一类存在于动植物体内、大小为21一25nt的内源性非编码单链小分子RNA，其在细胞内具有多种重要的调节作用。每个miRNA可以有多个靶基因，而几个miRNA也可以调节同一个基因。这种复杂的调节网络既可以通过一个miRNA来调控多个基因的表达，也可以通过几个miRNA的组合来精细调控某个基因的表达。

近年来，发现和鉴定的miRNAs越来越多，但植物miRNAs仅占很小一部分，且主要集中于拟南芥和水稻等少数模式植物中，植物miRNA的靶基因大多编码转录因子，与植物的生长、发育密切相关；而在动物和人中发现大量miR—NA，已证实在动物的生长、发育和疾病发生等过程中起重要作用。是一类存在于动植物体内、大小为21一25nt的内源性非编码单链小分子RNA，对生物体转录后的基因表达调控起关键作用。

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lncRNA

长链非编码RNA，是长度大于200个核苷酸的非编码RNA研究表明。lncRNA在剂量补偿效应(Dosage compensationeffect)、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用，成为遗传学研究热点。

1.直接和蛋白（一般都是转移因子/转录调节子）结合，从而阻断了该分子的作用和信号通路。

2.在细胞中起到microRNA海绵（microRNA sponge）的作用。

3.与蛋白结合，然后将蛋白复合物定位到特定的DNA序列上。

4.调节mRNA的翻译。

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circRNA

circRNA是一类特殊的非编码RNA分子，也是RNA领域研究热点。

与传统的线性RNA（linear RNA，含5’和3’末端）不同，circRNA分子呈封闭环状结构，不受RNA外切酶影响，表达更稳定，不易降解。在功能上，近年的研究表明，circRNA分子富含miRNA结合位点，在细胞中起到miRNA海绵的作用，进而解除miRNA对靶基因的抑制作用，升高靶基因的表达水平；这一作用机制被称为ceRNA机制。通过与疾病关联的miRNA相互作用， circRNA在疾病中发挥着重要的调控作用。

ceRNA机制。通过与疾病关联的miRNA相互作用， circRNA在疾病中发挥着重要的调控作用。