单细胞测序产品-欧易生物

单细胞测序产品-欧易生物

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提供商 :上海欧易生物医学科技有限公司

服务名称 :不同平台单细胞转录组测序

单细胞转录组测序
 
单细胞转录组测序是在单个细胞水平进行高通量转录组测序的一项新技术,能够有效解决细胞异质性以及bulk RNA-seq被掩盖的细胞群内转录组异质性难题,有助于发现新的稀有细胞类型,了解细胞生长过程中基因的表达调控机制。基于10x Genomics和BD RhapsodyTM平台可以实现单个样本数千甚至上万个单细胞群体分析,解决传统单细胞测序在通量或扩展性方面存在的不足,为单细胞研究开拓了新的思路。
 

服务优势

10x Genomics及BD RhapsodyTM双平台
同时具备10x Genomics及BD RhapsodyTM双平台,满足客户的不同需求

硬件优势支撑
300m2独立实验室,10x Genomics CSP双认证实验平台,多套计算集群,保证数据产出质量和分析速度

丰富的样本处理及项目经验
至2021年底,已完成1000+个项目、8000+例样本的单细胞解离与测序,参与或协助客户发表50余篇高水平文章。
4余年深耕积累,提供优质的单细胞科研服务保障

专业售后团队+优质的售后服务理念
有丰富(逾万次)的单细胞后续分析经验,与客户充分互动课题设计背景,提供定制化分析内容,满足个性化需求,高效的进行沟通反馈及分析交付


一、10×Genomice单细胞转录组

10x Genomics Chromium系统利用微流控、油包水的微反应体系,通过序列标签(cellbarcode和UMI)区别群体中的不同细胞和转录本,获得单细胞水平的基因表达谱,实现数千甚至上万个单细胞群体分析。
 
                                                               
图 | 10x Genomics单细胞转录组原理图(来源:10x Genomics)

图 |10x Genomics Chromium技术核心–油滴包裹的凝胶珠(GEMs)(来源:10x Genomics)
 
技术优势
 

通量高:一次可以同时测8个样本,每个样本最多可以检测到上万个细胞

周期短17分钟内完成上万个细胞封装,一天之内完成细胞悬液制备、单细胞捕获、扩增以及建库

捕获效率高细胞捕获效率高达65%

应用范围广动物细胞和植物细胞均可以进行单细胞测序,已广泛应用于肿瘤细胞异质性、免疫细胞群体检测和胚胎发育研究等

 

二、BD Rhapsody TM单细胞转录组
 

BD RhapsodyTM单细胞捕获其技术原理的关键是利用自然沉降的方法。先让单细胞悬液流过蜂窝板(蜂窝板上有20万+的微孔,数量远大于投入的细胞数量),让细胞落入微孔中。细胞分别落入微孔后,随后在蜂窝板上铺上过量磁珠,确保绝大多数微孔都落入了磁珠;冲洗过量的磁珠后,绝大部分微孔中均含有单个的磁珠,最终在微孔中形成“磁珠-细胞-反应试剂”的体系,细胞裂解,mRNA被磁珠上的barcode序列捕获;最后将捕获了mRNA的磁珠进行回收,并完成cDNA合成,最终构建标准测序文库。

图 | BD Rhapsody™微孔捕获技术原理示意图(来源:BD Rhapsody™)
 

技术优势

通量高:平台成本低,通量高

捕获效率高:捕获率高达80%,由于没有微流通道,因此无需担心通道堵塞的问题

实时监控:可通过屏幕随时监控微孔板的状态进行细胞质控

对细胞悬液的宽容度高

10x Genomics要求80%的细胞活率让不少人为之发愁,而BD Rhapsody应对65%细胞活率的样本仍游刃有余,细胞碎片和红细胞对其稳定性的影响也非常有限,非常适合处理难度高临床样本

三、墨卓MobiMicrobe TM单细胞转录组

墨卓单细胞平台采用液滴微流控技术,将单细胞悬浮液、反转录试剂以及墨卓微球三者结合,被油滴包裹,从而将单个细胞分隔在单个油包水液滴里。油包水液滴内细胞裂解,释放的mRNA被微球上的序列捕获,通过逆转录反应把细胞标签和cDNA产物连接在一起。接下来,再将油包水破碎,以cDNA为模板进行PCR扩增、质检、测序文库构建、测序和数据分析。

图 | MobiNova单细胞转录组测序实验流程图(来源:墨卓官方)

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