群体表观基因组研究利器-甲基化芯片—MSA270K

随着过去十年，大量的表观遗传学在人类健康和疾病中研究表明，DNA甲基化分析可以为基因调控机制提供有价值的信息，有助于识别和指定生物标志物。3月初春，Illumina重磅推出【新产品甲基化芯片—MSA270K】，可用于群体表观基因组研究，以及近两年国内外关注的表观遗传衰老时钟研究。2024.3.1-3.31果壳生物开启预售，具体优惠请联系销售。
随着研究者们对甲基化的的认识不断更新，甲基化的研究也从探索发现阶段迈入了应用转化阶段。因此，相比更为价格昂贵的全基因组甲基化检测，现阶段更具针对性的甲基化检测工具将更具性价比。Infinium MSA270K应运而生，芯片共覆盖27万个甲基化位点，该芯片聚焦与常见人类特征、疾病表型、环境暴露、衰老等相关内容。在保证高度准确的情况下，将单芯片检测通量提高48个样本，是Infinium 甲基化v2.0的4倍，通量更高，成本更低。

Infinium MSA270K

MSA270K甲基化芯片和935K甲基化位点对比




MSA270K和 甲基化芯片 v2.0
BeadChip独特甲基化位点的重叠情况。

MSA270K甲基化芯片和疾病相关位点
MSA270K甲基化芯片上约 50% 的位点来自于对已发布数据、科学文献和 Infinium甲基化芯片的分析。所选内容与多种生物类别相关，包括心血管、代谢、精神疾病、自身免疫、呼吸系统、生殖、肾脏、衰老、遗传、环境暴露以及感染相关特征和疾病。并且还包含已有Infinium BeadChip 平台的表观遗传时钟（甲基化时钟）和细胞反卷积的panel。


Infinium MSA性状关联位点数量

性状关联富集比较

除此之外，MSA270K甲基化芯片骨架还包括从公开的全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBS）数据集中筛选出来的与细胞类型、基因表达、染色质可及性、单等位基因甲基化和个体间甲基化变异的相关联内容。

MSA270K甲基化芯片性能检测数据
MSA270K甲基化芯片采用Infinium 芯片化学技术针对分析的每个 CpG 位点使用多个磁珠重复，每个磁珠附有数千个探针，以提供准确可靠的检测结果。内部测试数据显示，Infinium MSA270K 可重现性超过98%，并且与Infinium 甲基化v2.0（935K）重叠探针的可重现性也超过96%。

Infinium MSA芯片性能

检测通量对比

综上，MSA270K甲基化芯片 针对常见疾病、环境暴露、衰老、细胞类型、SNP 等甲基化关联的高度可扩展分析提供重点内容。