4D-label free定量蛋白质组学

提供商 ：武汉

服务名称 ：武汉傲星生物科技有限公司

实验介绍
4D-label free蛋白质组学是基于timsTOF Pro离子淌度平台的新一代非标记蛋白组学技术，通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂（ddaPASEF）扫描模式进行差异定量蛋白质组学分析。该技术是对传统label free蛋白质组学的升级，其核心是将数据依赖采集（DDA）与同步累积连续碎裂（PASEF）相结合，外加第四维度的离子淌度分离（基于肽段的碰撞截面积CCS），提高离子利用率和鉴定精准度，以更少上样量、更快扫描速度，实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。
实验流程

应用方向
药物应答、基因敲除/过表达的蛋白表达谱分析
植物、微生物生长发育与胁迫逆境生理研究
疾病生物标志物与药物作用靶点高通量分析
蛋白作用机制与特殊功能蛋白质筛选
各种物种的蛋白质组草图构建
临床微量样本最佳检测方式，如：外泌体、FFPE石蜡切片、活检穿刺组织等
数据分析

标准数据分析内容
蛋白质总鉴定数量分析	蛋定与定量结果统计、差异结果统计、火山图、聚类热图
差异蛋白质功能分析	亚细胞定位、结构域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作网络分析
质量控制分析	肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布
高级数据分析内容
WGCNA共表达分析	获得与表型强关联的核心蛋白质
趋势聚类分析	探讨蛋白质的表达趋势模式

技术优势
▶ 4D技术加持，更加适合微量样本
▶ 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制，灵活方便
▶ 采用布鲁克的timsTOF Pro质谱平台，检测速度提升近一倍