重磅推出 | 核酸修饰定量检测（液相-质谱联用）技术服务

 产品介绍  RNA 上的化学修饰对于RNA的结构和功能起到了重要的调控作用，阐明RNA修饰的生物学意义需要能特异性检测、量化修饰核苷进行高灵敏度分析的工具。目前常用的检测方法，主要采用液相色谱与质谱联用(coupling of liquid chromatography to mass spectrometry, LC-MS) 技术。表观生物利用SCIEX Triple Quad 4500质谱平台，可精确检测10种常见的RNA修饰类型在各类样本中的修饰丰度。 

 

 仪器信息  液质联用仪：Applied Biosystems型号：ExionLC AD / SCIEX Triple Quad 4500离子源：TurbolonSpray色谱柱：Agilent ZORBAX SB-Aq column（4.6 × 50 mm；填料尺寸1.8 μm）

 

 

 

 

 修饰检测 

RNA：m1A、m6A、m5C、pseudoU、4SU、5EU 、m7G、m6Am、N6,N6-mA、ac4C

可单独提供以下DNA修饰类型检测：6mA、5mC、5hmC、5hmU

 

 

 样品要求 

RNA样本，≥ 200 ng/样本（至少3次技术重复数据）

 

 服务周期 

20个工作日

 

 

 结果示例 

 

1. 原始数据：MS intensity-time数据，包括总离子色谱图（TIC）和单离子峰图（XIC）。

 

 

2. 样品修饰比例定量：标准曲线数据和样品定量结果。

 

 

 案例 

Mol Cancer：FBW7通过靶向N 6-甲基腺苷结合蛋白YTHDF2抑制卵巢癌的发展^[1]本研究鉴定了FBW7在卵巢癌中的潜在底物，并在体外和体内模型研究FBW7的生物学效应。利用LC/MS检测了卵巢癌组织中的m6A水平，再通过meRIP-seq和RNA-seq评估YTHDF2的下游靶标，综上表明FBW7通过拮抗卵巢癌中的YTHDF2介导的BMF mRNA衰变来抑制肿瘤的生长和进展。

LC-MS/MS检测敲降YTHDF2敲降组与对照组的RNA m6A水平

 

 

参考文献

[1] Xu F, Li J, Ni M, et al. FBW7 suppresses ovarian cancer development by targeting the N6-methyladenosine binding protein YTHDF2. Mol Cancer. 2021 Mar 3;20(1):45.